Etude in silico des mutations de la protéine S « spike protein » détectées dans les principaux variants du SARS-CoV-2 aperçus en Algérie. / Nazim Ksir 

Public ISBD Titre : Etude in silico des mutations de la protéine S « spike protein » détectées dans les principaux variants du SARS-CoV-2 aperçus en Algérie. Type de document : texte imprimé Auteurs : Nazim Ksir, Auteur ; Khawla Otmani, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2021 Importance : 99 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Animale Tags : Coronavirus, COVID19, SARS-COV-2, Variant, ACE2, Protéine S, RBD, alignement séquence,Génétique. Index. décimale : 750 Biologie Animale Résumé : L’émergence de la maladie du syndrome respiratoire aigu sévère à coronavirus 2 (SARS-COV-2) en Chine fin 2019 a provoqué une vaste épidémie mondiale et constitue un problème majeur pour la santé publique. Malgré la lenteur de l'évolution du SARS-COV-2 par rapport aux autres virus à ARN, sa transmission massive et rapide pendant la pandémie mondiale lui a permis d’évoluer par l’acquisition d’une diversité génétique importante qui a conduit à l'émergence de nombreux variants, parmi lesquelles certains possèdent des mutations inquiétantes qui semblent avoir un impact sur la transmissibilité du virus, les manifestations cliniques, la mortalité ainsi que sur l’évasion immunitaire qui constitue le principale frein au développement d’un vaccin efficace contre les différentes souches du SARS-COV-2. Actuellement le GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) a répertorié plus de 250 mutations au niveau du génome du SARS-COV-2 dont 60 mutations au niveau de la protéine S, cette fréquence élevée de mutations au niveau de la protéine S reflète son importance d’où l’intérêt de l’étudier. Le présent travail a pour objectif d’étudier la protéine S et les mutations détectées dans sa séquence génomique, pour cela nous allons utiliser les séquences protéiques de la protéine S des différentes souches du SARS-COV-2 présentes dans les bases de données génomiques et les traiter par un algorithme d’alignement multiple pour les aligner et les comparer entre elles et par rapport à la souche ancestrale. Les résultats sont assez explicites en eux même et sont conformes aux données scientifiques des recherches déjà effectuées à savoir que la fréquence de mutation de la protéine S est plus élevée par rapport aux autres domaines du génome du SARS-COV-2 et que les mutations qui s’y produisent tout particulièrement au niveau du domaine RBD sont les plus dangereuses et qui ont eu le plus d’impacts sur la transmissibilité, l’évasion immunitaire et sur l’efficacité des vaccins. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15853 Etude in silico des mutations de la protéine S « spike protein » détectées dans les principaux variants du SARS-CoV-2 aperçus en Algérie. [texte imprimé] / Nazim Ksir, Auteur ; Khawla Otmani, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 99 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Animale Tags : Coronavirus, COVID19, SARS-COV-2, Variant, ACE2, Protéine S, RBD, alignement séquence,Génétique. Index. décimale : 750 Biologie Animale Résumé : L’émergence de la maladie du syndrome respiratoire aigu sévère à coronavirus 2 (SARS-COV-2) en Chine fin 2019 a provoqué une vaste épidémie mondiale et constitue un problème majeur pour la santé publique. Malgré la lenteur de l'évolution du SARS-COV-2 par rapport aux autres virus à ARN, sa transmission massive et rapide pendant la pandémie mondiale lui a permis d’évoluer par l’acquisition d’une diversité génétique importante qui a conduit à l'émergence de nombreux variants, parmi lesquelles certains possèdent des mutations inquiétantes qui semblent avoir un impact sur la transmissibilité du virus, les manifestations cliniques, la mortalité ainsi que sur l’évasion immunitaire qui constitue le principale frein au développement d’un vaccin efficace contre les différentes souches du SARS-COV-2. Actuellement le GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) a répertorié plus de 250 mutations au niveau du génome du SARS-COV-2 dont 60 mutations au niveau de la protéine S, cette fréquence élevée de mutations au niveau de la protéine S reflète son importance d’où l’intérêt de l’étudier. Le présent travail a pour objectif d’étudier la protéine S et les mutations détectées dans sa séquence génomique, pour cela nous allons utiliser les séquences protéiques de la protéine S des différentes souches du SARS-COV-2 présentes dans les bases de données génomiques et les traiter par un algorithme d’alignement multiple pour les aligner et les comparer entre elles et par rapport à la souche ancestrale. Les résultats sont assez explicites en eux même et sont conformes aux données scientifiques des recherches déjà effectuées à savoir que la fréquence de mutation de la protéine S est plus élevée par rapport aux autres domaines du génome du SARS-COV-2 et que les mutations qui s’y produisent tout particulièrement au niveau du domaine RBD sont les plus dangereuses et qui ont eu le plus d’impacts sur la transmissibilité, l’évasion immunitaire et sur l’efficacité des vaccins. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15853

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