Modélisation du mode d’interaction de quelques dérivés polyhydroquinolines avec COX1, COX2 / Aimene Nadjet 

Public ISBD Titre : Modélisation du mode d’interaction de quelques dérivés polyhydroquinolines avec COX1, COX2 Type de document : texte imprimé Auteurs : Aimene Nadjet, Auteur ; Yamina Boudehane, Auteur ; Adel Krid, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2016 Importance : 49 f. Format : 30 cm. Note générale : une copie electronique disponible en BUC Langues : Français (fre) Catégories : Sciences Exactes:Chimie Tags : Chimie theorique appliquee  Sciences Exactes Index. décimale : 540 Chimie Résumé : L’objectif principal de notre travail est focalisé sur la modélisation des interactions entre douze molécules (ligands) polyhydroquinolines et les deux iso- formes de la COX (1Q4G et 1CVU) qui représentent deux cibles potentielles dans le traitement de l’inflammation. Pour cela nous avons procédé comme suit : En premier lieu, nous avons optimisé nos ligands avec la mécanique moléculaire (MM) afin d’avoir un minimum énergétique. En second lieu, nous avons appliqué la technique du docking moléculaire afin de rationaliser et modéliser le mode d’interaction des douze ligands déjà décrits avec les deux COXs d’une part et l’évaluation de l’énergie de complexes obtenus d’autre part. Pour cela nous avons utilisé le logiciel Autodock-vina qui est un logiciel d’amarrage moléculaire très répondu et connu par sa fiabilité et son pouvoir de reproduire les ligands déjà complexés et utilisé dans le criblage virtuel. Le logiciel DSViewer nous a permis la visualisation des différentes interactions. Les complexes les plus stables ont été trouvées entre :- La molécule 5f et l’entrée 1Q4G (COX1) avec une énergie de -7.9 kcal/mol. Ce complexe possède un réseau de deux liaisons hydrogènes, une interaction électrostatique et plusieurs interactions hydrophobiques. Le second complexe formé entre la molécule 5g et l’entrée 1CVU (COX2) possède une énergie de -8.3 kcal/mol. Contrairement a son homologue déjà mentionné, ce complexe est formé par plusieures interactions dont cinq liaisons hydrogène qui sont les interactions les plus majoritaires. De même cinq interactions hydrophobiques ont participé à la formation de ce complexe d’où sa stabilité relative supérieure à celle du premier complexe. La molécule 5g possède plus d’atomes d’oxygène accepteur et donneurs de liaisons hydrogène que la molécule 5f, ce qui implique que la 5g forme plus d’interaction. L’application de la règle de Lipinski nous a permis de découvrir que les trois ligands 5h, 5j et 5i ne sont ni prometteuses, ni thérapeutiques. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3268 Modélisation du mode d’interaction de quelques dérivés polyhydroquinolines avec COX1, COX2 [texte imprimé] / Aimene Nadjet, Auteur ; Yamina Boudehane, Auteur ; Adel Krid, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2016 . - 49 f. ; 30 cm. une copie electronique disponible en BUC Langues : Français (fre) Catégories : Sciences Exactes:Chimie Tags : Chimie theorique appliquee  Sciences Exactes Index. décimale : 540 Chimie Résumé : L’objectif principal de notre travail est focalisé sur la modélisation des interactions entre douze molécules (ligands) polyhydroquinolines et les deux iso- formes de la COX (1Q4G et 1CVU) qui représentent deux cibles potentielles dans le traitement de l’inflammation. Pour cela nous avons procédé comme suit : En premier lieu, nous avons optimisé nos ligands avec la mécanique moléculaire (MM) afin d’avoir un minimum énergétique. En second lieu, nous avons appliqué la technique du docking moléculaire afin de rationaliser et modéliser le mode d’interaction des douze ligands déjà décrits avec les deux COXs d’une part et l’évaluation de l’énergie de complexes obtenus d’autre part. Pour cela nous avons utilisé le logiciel Autodock-vina qui est un logiciel d’amarrage moléculaire très répondu et connu par sa fiabilité et son pouvoir de reproduire les ligands déjà complexés et utilisé dans le criblage virtuel. Le logiciel DSViewer nous a permis la visualisation des différentes interactions. Les complexes les plus stables ont été trouvées entre :- La molécule 5f et l’entrée 1Q4G (COX1) avec une énergie de -7.9 kcal/mol. Ce complexe possède un réseau de deux liaisons hydrogènes, une interaction électrostatique et plusieurs interactions hydrophobiques. Le second complexe formé entre la molécule 5g et l’entrée 1CVU (COX2) possède une énergie de -8.3 kcal/mol. Contrairement a son homologue déjà mentionné, ce complexe est formé par plusieures interactions dont cinq liaisons hydrogène qui sont les interactions les plus majoritaires. De même cinq interactions hydrophobiques ont participé à la formation de ce complexe d’où sa stabilité relative supérieure à celle du premier complexe. La molécule 5g possède plus d’atomes d’oxygène accepteur et donneurs de liaisons hydrogène que la molécule 5f, ce qui implique que la 5g forme plus d’interaction. L’application de la règle de Lipinski nous a permis de découvrir que les trois ligands 5h, 5j et 5i ne sont ni prometteuses, ni thérapeutiques. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3268

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