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Auteur M. A Hamidechi |
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Affiner la recherche Interroger des sources externesAnalyse et prévalence du risque infectieux de Listeria monocytogenes dans les laits crus récoltés dans deux régions à climat différent (zone semi-aride et le Nord-Est algérien) / Abdelhafid Boubendir
Titre : Analyse et prévalence du risque infectieux de Listeria monocytogenes dans les laits crus récoltés dans deux régions à climat différent (zone semi-aride et le Nord-Est algérien) : Modélisation spatiale de la diversité floristique Type de document : texte imprimé Auteurs : Abdelhafid Boubendir, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : Constantine : Université Mentouri Constantine Année de publication : 2012 Importance : 145 f. Format : 31 cm. Note générale : Doctorat es sciences
2 copies imprimées disponiblesLangues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Incidence listeria spp. lait cru Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Diplôme : Doctorat en sciences En ligne : ../theses/biologie/BOU6193.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=6136 Analyse et prévalence du risque infectieux de Listeria monocytogenes dans les laits crus récoltés dans deux régions à climat différent (zone semi-aride et le Nord-Est algérien) : Modélisation spatiale de la diversité floristique [texte imprimé] / Abdelhafid Boubendir, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse . - Constantine : Université Mentouri Constantine, 2012 . - 145 f. ; 31 cm.
Doctorat es sciences
2 copies imprimées disponibles
Langues : Français (fre)
Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Incidence listeria spp. lait cru Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Diplôme : Doctorat en sciences En ligne : ../theses/biologie/BOU6193.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=6136 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité BOU/6193 BOU/6193 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible
Titre : Application des outils biomoléculaires 16S, MALDI-TOF et métagénomique pour la détermination des variantes taxonomiques bactériennes telluriques Type de document : texte imprimé Auteurs : Kaoutar Khelili, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : Constantine : Université Mentouri Constantine Année de publication : 2015 Importance : 119 f. Format : 30 cm. Note générale : 2 copies imprimées disponibles
Langues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Biotechnologies microbiennes.génomes et environnement Bactéries telluriques MALDI-TOF MS ADNr 16S métagénomique diversité bactérienne Soil bacteria 16S rDNA metagenomics bacterial diversity بكتريا التربة التنوع البكتيري Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé : The traditional bacterial culture techniques are not sufficient to study the terrestrial bacterial populations. By against, molecular biology techniques have a power of high discrimination and they are the current methods for the identification of different bacterial taxonomic variants, allowing a finer approach in the diversity studies. The full exploration of bacterial diversity has always been a challenge; this is due to the complexity, to heterogeneity
of the soil matrix and the existence of populations numerically small and rarely detected by conventional techniques.
In this thesis, we used three molecular techniques (MALDI-TOF MS, the 16S and metagenomics) to achieve the following objectives: (i) to demonstrate the applicability of the MALDI-TOF MS in the field of soil microbiology, (ii) measure the bacterial diversity of the region ""El-Meridj"" (city of Constantine, Algeria) through metagenomics and (iii) study the effect of physicochemical characteristics on this biodiversity. In the first part, we confirmed
the susceptibility of proteomics technology MALDI-TOF MS to identify all our bacterial isolates (9 strains) in species level with a score greater than 2,000 and in record time compared to phenotypic techniques and genotypic techniques (amplification and sequencing of the 16S rDNA). In the second part, the 454 pyrosequencing of metagenomes isolated from three soil samples (lake soil, forest soil and cultivated soil) reveals the presence of 11 phyla,
20 families and 13 genera. Thus, the calculation of diversity indices (Shannon-Weaver index, Inverse Simpson index and Chao1 index) showed that the soil in the area ""El-Meridj""
contains significant heterogeneity of bacterial population and a fair distribution of species richness which can be correlated to the alkaline pH of this region and the high organic content.
Our work clearly shows that it is possible to improve access to different telluric bacterial taxonomic variations by the application of MALDI-TOF MS as routine identification system to soil microbiology laboratories and metagenomics for diversity studies
Diplôme : Doctorat En ligne : ../theses/biologie/KHE6711.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=9912 Application des outils biomoléculaires 16S, MALDI-TOF et métagénomique pour la détermination des variantes taxonomiques bactériennes telluriques [texte imprimé] / Kaoutar Khelili, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse . - Constantine : Université Mentouri Constantine, 2015 . - 119 f. ; 30 cm.
2 copies imprimées disponibles
Langues : Français (fre)
Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Biotechnologies microbiennes.génomes et environnement Bactéries telluriques MALDI-TOF MS ADNr 16S métagénomique diversité bactérienne Soil bacteria 16S rDNA metagenomics bacterial diversity بكتريا التربة التنوع البكتيري Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé : The traditional bacterial culture techniques are not sufficient to study the terrestrial bacterial populations. By against, molecular biology techniques have a power of high discrimination and they are the current methods for the identification of different bacterial taxonomic variants, allowing a finer approach in the diversity studies. The full exploration of bacterial diversity has always been a challenge; this is due to the complexity, to heterogeneity
of the soil matrix and the existence of populations numerically small and rarely detected by conventional techniques.
In this thesis, we used three molecular techniques (MALDI-TOF MS, the 16S and metagenomics) to achieve the following objectives: (i) to demonstrate the applicability of the MALDI-TOF MS in the field of soil microbiology, (ii) measure the bacterial diversity of the region ""El-Meridj"" (city of Constantine, Algeria) through metagenomics and (iii) study the effect of physicochemical characteristics on this biodiversity. In the first part, we confirmed
the susceptibility of proteomics technology MALDI-TOF MS to identify all our bacterial isolates (9 strains) in species level with a score greater than 2,000 and in record time compared to phenotypic techniques and genotypic techniques (amplification and sequencing of the 16S rDNA). In the second part, the 454 pyrosequencing of metagenomes isolated from three soil samples (lake soil, forest soil and cultivated soil) reveals the presence of 11 phyla,
20 families and 13 genera. Thus, the calculation of diversity indices (Shannon-Weaver index, Inverse Simpson index and Chao1 index) showed that the soil in the area ""El-Meridj""
contains significant heterogeneity of bacterial population and a fair distribution of species richness which can be correlated to the alkaline pH of this region and the high organic content.
Our work clearly shows that it is possible to improve access to different telluric bacterial taxonomic variations by the application of MALDI-TOF MS as routine identification system to soil microbiology laboratories and metagenomics for diversity studies
Diplôme : Doctorat En ligne : ../theses/biologie/KHE6711.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=9912 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité KHE/6711 KHE/6711 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible
Titre : Contribution du diagnostic biochimique bactérien dans l’établissement des parentés phylogénétiques : Cas des Entérobactéries et Pseudomonas. Type de document : texte imprimé Auteurs : Meriem Meziani, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : Constantine : Université Mentouri Constantine Année de publication : 2012 Importance : 79 f. Format : 31 cm. Note générale : 2 copies imprimées disponibles Langues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Biochimie:Technologie des explorations biochimiques Entérobactéries phénotype biochimique phylogénie Enterobacteria Biochemical phenotype Phylogeny الامعائیات النمط الظاھري البیوكیمیائي نسالة Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé : Ten bacterial strains were isolated from clinical specimens provided by the bacteriology laboratory (DAKSI). They were identified by standard microbiological methods (biochemical gallery). Among the ten strains studied, eight strains belonging to the Enterobacteriaceae and two strains are among the Gram-negative bacilli non-fermentative (Pseudomonas). These strains were identified presumptively by their biochemical characteristics, susceptibility or resistance to antibiotics, and total nitrogen measured by the Kjeldahl method.
A phylogenetic profile was produced by phenetic distance methods, using NJ algorithm and sequence analysis of 16S DNA. The analysis of topologies obtained was used to determine the place of the biochemical phenotype in establishing phylogenetic relationships.Note de contenu : Annexes. Diplôme : Magistère En ligne : ../theses/biologie/MEZ6113.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=6028 Contribution du diagnostic biochimique bactérien dans l’établissement des parentés phylogénétiques : Cas des Entérobactéries et Pseudomonas. [texte imprimé] / Meriem Meziani, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse . - Constantine : Université Mentouri Constantine, 2012 . - 79 f. ; 31 cm.
2 copies imprimées disponibles
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Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Biochimie:Technologie des explorations biochimiques Entérobactéries phénotype biochimique phylogénie Enterobacteria Biochemical phenotype Phylogeny الامعائیات النمط الظاھري البیوكیمیائي نسالة Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé : Ten bacterial strains were isolated from clinical specimens provided by the bacteriology laboratory (DAKSI). They were identified by standard microbiological methods (biochemical gallery). Among the ten strains studied, eight strains belonging to the Enterobacteriaceae and two strains are among the Gram-negative bacilli non-fermentative (Pseudomonas). These strains were identified presumptively by their biochemical characteristics, susceptibility or resistance to antibiotics, and total nitrogen measured by the Kjeldahl method.
A phylogenetic profile was produced by phenetic distance methods, using NJ algorithm and sequence analysis of 16S DNA. The analysis of topologies obtained was used to determine the place of the biochemical phenotype in establishing phylogenetic relationships.Note de contenu : Annexes. Diplôme : Magistère En ligne : ../theses/biologie/MEZ6113.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=6028 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MEZ/6113 MEZ/6113 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible
Titre : Evaluation et taxonomie numérique de la flore Listeria spp. Dans un environnement d’élevage bovin Type de document : texte imprimé Auteurs : Saliha Kaouache, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : Constantine : Université Mentouri Constantine Année de publication : 2011 Importance : 83 f. Format : 31 cm Note générale : Magister
2 copies imprimées disponiblesLangues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Listeria.spp. Taxonomie Numérique Arbre phylogénétique. Biologie Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie En ligne : ../theses/biologie/KAO5882.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=5686 Evaluation et taxonomie numérique de la flore Listeria spp. Dans un environnement d’élevage bovin [texte imprimé] / Saliha Kaouache, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse . - Constantine : Université Mentouri Constantine, 2011 . - 83 f. ; 31 cm.
Magister
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BiologieTags : Listeria.spp. Taxonomie Numérique Arbre phylogénétique. Biologie Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie En ligne : ../theses/biologie/KAO5882.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=5686 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité KAO/5882 KAO/5882 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible
Titre : Incidence de Listeria spp. et interaction phylogénétique avec la flore bactérienne isolée de laits crus Type de document : texte imprimé Auteurs : Nassima Azizi, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : Constantine : Université Mentouri Constantine Année de publication : 2011 Importance : 85 f. Format : 31 cm Note générale : Magister
2 copies imprimées disponiblesLangues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Lait cru Listeria spp. Phylogénie. Biologie Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie En ligne : ../theses/biologie/AZI5902.pdf Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=5710 Incidence de Listeria spp. et interaction phylogénétique avec la flore bactérienne isolée de laits crus [texte imprimé] / Nassima Azizi, Auteur ; M. A Hamidechi, Directeur de thèse . - Constantine : Université Mentouri Constantine, 2011 . - 85 f. ; 31 cm.
Magister
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BiologieTags : Lait cru Listeria spp. Phylogénie. Biologie Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie En ligne : ../theses/biologie/AZI5902.pdf Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=5710 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité AZI/5902 AZI/5902 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible
