Titre :	Application du docking moléculaire par surflex pour la mise en évidence des nouveaux inhibiteurs de la kinase dépendante de la cycline 2 (cdk2) .
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	El hadj tayeb Ghadhab, Auteur ; Maroua Soufi, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse
Editeur :	CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine
Année de publication :	2020
Importance :	127 f.
Format :	30 cm.
Note générale :	Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues :	Français (fre)
Catégories :	Biologie:Biologie Appliquée
Tags :	Mots clés : Docking moléculaire, Criblage virtuel, Surflex, RMSD, cdk2, Cancer, Inhibition, Lipinski, Biochimie Appliquée.
Index. décimale :	710 Biologie Appliquée
Résumé :	Résumé: La kinase dépendante de la cycline 2 représente une cible importante pour les traitements anticancéreux. Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur que le composé «CK2» qui agit sur la cible cdk2, enzyme impliquée dans les tumeurs. Le programme de docking moléculaire Surflex a été développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 65,5 % et un coefficient de corrélation de -0,63, les performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Un criblage virtuel a été effectué sur une collection de 236 structures avec un taux de similarité de 92% à notre ligand de référence ont été téléchargés à partir de la chimiothèque « PubChem » afin d’évaluer leur affinité envers la cdk2. Parmi les 236 structures, 22 composés ont présenté des affinités supérieures à celle de notre ligand qui est de 4.63M-1. Les résultats du criblage virtuel par le logiciel Surflex nous a permis de sélectionner les 5 meilleurs composés qui peuvent être proposés comme meilleurs inhibiteurs de notre cible thérapeutique cdk2 et pour lesquels nous avons fait une analyse détaillée des diverses interactions. Nous avons complété nos essais de modélisation structurale par 20 mono substitutions et 35 bi substitutions, dans le but d’améliorer son action inhibitrice. Parmi lesquelles dix-sept (17) composés substitués ont eu des affinités améliorées : La mono substitution concerne 20 composés et a permis une amélioration de l’affinité pour 8 composés ; la meilleure (8.95 M-1) étant celle du composé n°1. De la bi substitution résulte 35 composés parmi lesquels neuf (9) ont des affinités améliorées supérieures à 8.95 M-1 ; la meilleure étant celle du composé n°29 qui égale à 9.62 M-1. Enfin, l'application de la règle de Lipinski nous informe de manière positive sur les propriétés physicochimiques de ces nouvelles molécules ainsi que sur leur biodisponibilité par voie orale comme médicament qui ne posera aucun problème. Il est nécessaire de vérifier et valider nos résultats théoriques par une étude expérimentale in vitro et/ou in vivo
Diplome :	Master 2
Permalink :	https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=13286

Application du docking moléculaire par surflex pour la mise en évidence des nouveaux inhibiteurs de la kinase dépendante de la cycline 2 (cdk2) . [texte imprimé] / El hadj tayeb Ghadhab, Auteur ; Maroua Soufi, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2020 . - 127 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues : Français (fre)

Catégories :	Biologie:Biologie Appliquée
Tags :	Mots clés : Docking moléculaire, Criblage virtuel, Surflex, RMSD, cdk2, Cancer, Inhibition, Lipinski, Biochimie Appliquée.
Index. décimale :	710 Biologie Appliquée
Résumé :	Résumé: La kinase dépendante de la cycline 2 représente une cible importante pour les traitements anticancéreux. Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur que le composé «CK2» qui agit sur la cible cdk2, enzyme impliquée dans les tumeurs. Le programme de docking moléculaire Surflex a été développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 65,5 % et un coefficient de corrélation de -0,63, les performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Un criblage virtuel a été effectué sur une collection de 236 structures avec un taux de similarité de 92% à notre ligand de référence ont été téléchargés à partir de la chimiothèque « PubChem » afin d’évaluer leur affinité envers la cdk2. Parmi les 236 structures, 22 composés ont présenté des affinités supérieures à celle de notre ligand qui est de 4.63M-1. Les résultats du criblage virtuel par le logiciel Surflex nous a permis de sélectionner les 5 meilleurs composés qui peuvent être proposés comme meilleurs inhibiteurs de notre cible thérapeutique cdk2 et pour lesquels nous avons fait une analyse détaillée des diverses interactions. Nous avons complété nos essais de modélisation structurale par 20 mono substitutions et 35 bi substitutions, dans le but d’améliorer son action inhibitrice. Parmi lesquelles dix-sept (17) composés substitués ont eu des affinités améliorées : La mono substitution concerne 20 composés et a permis une amélioration de l’affinité pour 8 composés ; la meilleure (8.95 M-1) étant celle du composé n°1. De la bi substitution résulte 35 composés parmi lesquels neuf (9) ont des affinités améliorées supérieures à 8.95 M-1 ; la meilleure étant celle du composé n°29 qui égale à 9.62 M-1. Enfin, l'application de la règle de Lipinski nous informe de manière positive sur les propriétés physicochimiques de ces nouvelles molécules ainsi que sur leur biodisponibilité par voie orale comme médicament qui ne posera aucun problème. Il est nécessaire de vérifier et valider nos résultats théoriques par une étude expérimentale in vitro et/ou in vivo
Diplome :	Master 2
Permalink :	https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=13286