Titre :	Recherche par docking moléculaire de nouveaux inhibiteurs de la protéase de type papaine (PLpro) du SARS-CoV-2.
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	Aya Brika, Auteur ; Chaima Chara, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse
Editeur :	CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine
Année de publication :	2021
Importance :	118 f.
Format :	30 cm.
Note générale :	Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues :	Français (fre)
Catégories :	Biologie:Biologie Appliquée
Tags :	Coronavirus, SARS, docking moléculaire, Surflex, PL protéase, ADMET,Biochimie Appliquée.
Index. décimale :	710 Biologie Appliquée
Résumé :	En décembre 2019, un nouveau coronavirus était identifié dans la ville du Wuhan en Chine. Ce virus, responsable du syndrome respiratoire aigue sévère (SARS), se propage rapidement et provoque un effet catastrophique sur la population mondiale. Faisant appel aux méthodes de modélisation moléculaire et, plus particulièrement, au docking moléculaire par le logiciel Surflex, nous avons tenté de développer de nouveaux inhibiteurs plus efficaces de l’enzyme PL protéase. Nous avons effectué des mono-substitutions et des bi-substitutions en introduisant des modifications dans la structure de l’inhibiteur de référence « (3R)-3-((S)-2- ethoxypentanamido)-1-(1-(2-fluorophenyl)ethyl)-3-methylpyrrolidinium » dont l’affinité est de 3.92 M-1 afin d’obtenir des composés présentant des affinités supérieures. Les résultats de cette opération ont permis de sélectionner les deux meilleurs composés dont le B11 avec une affinité de 5.74 M-1 et le composé B’4 avec 7.17 M-1. Ensuite, nous avons évalué les propriétés physico-chimiques ainsi que le profil ADMET de ces composés via le serveur ADMETlab. Les résultats du profil ADMET n’étant pas satisfaisants pour les deux composés, nous avons effectué d’autres modifications pour essayer de les améliorer. Nous avons obtenu les composés C1 et C2 avec des affinités acceptables égales à 6.63 et 5.63 M-1 respectivement et présentant un bon profil ADMET. Ils peuvent être proposés comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de la PLpro. Cependant, des tests in vitro et in vivo sont indispensables pour valider ces deux molécules en tant qu’inhibiteurs de l’enzyme.
Diplome :	Master 2
Permalink :	https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15065

Recherche par docking moléculaire de nouveaux inhibiteurs de la protéase de type papaine (PLpro) du SARS-CoV-2. [texte imprimé] / Aya Brika, Auteur ; Chaima Chara, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 118 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues : Français (fre)

Catégories :	Biologie:Biologie Appliquée
Tags :	Coronavirus, SARS, docking moléculaire, Surflex, PL protéase, ADMET,Biochimie Appliquée.
Index. décimale :	710 Biologie Appliquée
Résumé :	En décembre 2019, un nouveau coronavirus était identifié dans la ville du Wuhan en Chine. Ce virus, responsable du syndrome respiratoire aigue sévère (SARS), se propage rapidement et provoque un effet catastrophique sur la population mondiale. Faisant appel aux méthodes de modélisation moléculaire et, plus particulièrement, au docking moléculaire par le logiciel Surflex, nous avons tenté de développer de nouveaux inhibiteurs plus efficaces de l’enzyme PL protéase. Nous avons effectué des mono-substitutions et des bi-substitutions en introduisant des modifications dans la structure de l’inhibiteur de référence « (3R)-3-((S)-2- ethoxypentanamido)-1-(1-(2-fluorophenyl)ethyl)-3-methylpyrrolidinium » dont l’affinité est de 3.92 M-1 afin d’obtenir des composés présentant des affinités supérieures. Les résultats de cette opération ont permis de sélectionner les deux meilleurs composés dont le B11 avec une affinité de 5.74 M-1 et le composé B’4 avec 7.17 M-1. Ensuite, nous avons évalué les propriétés physico-chimiques ainsi que le profil ADMET de ces composés via le serveur ADMETlab. Les résultats du profil ADMET n’étant pas satisfaisants pour les deux composés, nous avons effectué d’autres modifications pour essayer de les améliorer. Nous avons obtenu les composés C1 et C2 avec des affinités acceptables égales à 6.63 et 5.63 M-1 respectivement et présentant un bon profil ADMET. Ils peuvent être proposés comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de la PLpro. Cependant, des tests in vitro et in vivo sont indispensables pour valider ces deux molécules en tant qu’inhibiteurs de l’enzyme.
Diplome :	Master 2
Permalink :	https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15065