Titre :	Identification de nouveaux inhibiteurs potentiels de la protéine non structurale NSP 13 du SARS-CoV-2 : Etude in silico
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	Sihem Boukria, Auteur ; Chafika Bessa, Auteur ; Teniou S, Directeur de thèse
Editeur :	CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine
Année de publication :	2021
Importance :	96 f.
Format :	30 cm.
Note générale :	Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues :	Français (fre)
Catégories :	Biologie:Biologie Appliquée
Tags :	In silico, Docking Moléculaire, Surflex, SARS-CoV-2, Helicase nsp1,Biochimie Appliquée
Index. décimale :	710 Biologie Appliquée
Résumé :	À ce jour, le virus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (sars-cov-2) a fait près de 3,9 millions de morts dans le monde selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS). En l'absence de traitement approuvé contre la maladie COVID-19 causée par ce virus, ce chiffre continue d'augmenter. Une brise d'espoir souffle avec le premier vaccin approuvé, mais la pandémie continue à se propager avec de nouveaux variants émergeants. Il semble qu'une autre approche, doit être engagée. Dans cet état d'esprit, nous avons concentré notre étude sur l'inhibition "in silico" de l'hélicase (nsp 13) ; une enzyme essentielle pour la réplication virale et cible plausible de médicaments contre le SARS-Cov-2, en raison de son haut degré de conservation. Dans le but de repérer et d'évaluer les inhibiteurs potentiels de l’nsp13 du sars-cov-2, nous avons utilisé l'approche de docking moléculaire avec le programme Surflex ; elle consiste à prédire et à signaler les interactions protéine-ligand. Nous avons choisi le code PDB 5RLJ comme récepteur nsp13, ce dernier a été docké selon deux approches, la première était basée sur des molécules naturelles, dans la seconde approche nous avons utilisé plusieurs molécules substituées du VW4, qui est le ligand de référence pour cette PDB ID. Les interactions ont été visualisées en utilisant Biovia Discovery studio 2021, l'affinité a été améliorée de 3,58 M¯1 (pour le ligand VW4), à 6,98 M¯1. Parmi les molécules naturelles, l'acide rosmarinique semble avoir le meilleur potentiel d'inhibition de l’nsp13. Pour les composés substitués ; T1 a donné le meilleur score d’affinité (6.58 M-1). Enfin, Une évaluation positive des propriétés pharmacologiques par le serveur ADMETLAB 2.0 nous a donné de bonnes perspectives sur ces deux composés.
Diplome :	Master 2
Permalink :	https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15610

Identification de nouveaux inhibiteurs potentiels de la protéine non structurale NSP 13 du SARS-CoV-2 : Etude in silico [texte imprimé] / Sihem Boukria, Auteur ; Chafika Bessa, Auteur ; Teniou S, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 96 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues : Français (fre)

Catégories :	Biologie:Biologie Appliquée
Tags :	In silico, Docking Moléculaire, Surflex, SARS-CoV-2, Helicase nsp1,Biochimie Appliquée
Index. décimale :	710 Biologie Appliquée
Résumé :	À ce jour, le virus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (sars-cov-2) a fait près de 3,9 millions de morts dans le monde selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS). En l'absence de traitement approuvé contre la maladie COVID-19 causée par ce virus, ce chiffre continue d'augmenter. Une brise d'espoir souffle avec le premier vaccin approuvé, mais la pandémie continue à se propager avec de nouveaux variants émergeants. Il semble qu'une autre approche, doit être engagée. Dans cet état d'esprit, nous avons concentré notre étude sur l'inhibition "in silico" de l'hélicase (nsp 13) ; une enzyme essentielle pour la réplication virale et cible plausible de médicaments contre le SARS-Cov-2, en raison de son haut degré de conservation. Dans le but de repérer et d'évaluer les inhibiteurs potentiels de l’nsp13 du sars-cov-2, nous avons utilisé l'approche de docking moléculaire avec le programme Surflex ; elle consiste à prédire et à signaler les interactions protéine-ligand. Nous avons choisi le code PDB 5RLJ comme récepteur nsp13, ce dernier a été docké selon deux approches, la première était basée sur des molécules naturelles, dans la seconde approche nous avons utilisé plusieurs molécules substituées du VW4, qui est le ligand de référence pour cette PDB ID. Les interactions ont été visualisées en utilisant Biovia Discovery studio 2021, l'affinité a été améliorée de 3,58 M¯1 (pour le ligand VW4), à 6,98 M¯1. Parmi les molécules naturelles, l'acide rosmarinique semble avoir le meilleur potentiel d'inhibition de l’nsp13. Pour les composés substitués ; T1 a donné le meilleur score d’affinité (6.58 M-1). Enfin, Une évaluation positive des propriétés pharmacologiques par le serveur ADMETLAB 2.0 nous a donné de bonnes perspectives sur ces deux composés.
Diplome :	Master 2
Permalink :	https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15610