| Titre : |
Etude Comparative des Méthodes in Silico Etude Comparative des Méthodes in Silicopour la Détection des Ilots CpG. |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Amira Zarour, Auteur ; Djihad Chelia, Auteur ; Amira Gherboudj, Directeur de thèse |
| Editeur : |
CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine |
| Année de publication : |
2021 |
| Importance : |
52 f. |
| Format : |
30 cm. |
| Note générale : |
Une copie electronique PDF disponible au BUC |
| Langues : |
Français (fre) |
| Catégories : |
Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire
|
| Tags : |
Bioinformatique épigénétique île CpG Génome humain algorithmes de
détection, Bioinformatique. |
| Index. décimale : |
730 Biochimie et biologie cellulaire |
| Résumé : |
Les îlots CpG sont généralement connues sous le nom de régions de régulation
épigénétique, en fonction des modifications de l'histone, de la méthylation et de l'activité du
promoteur. La cartographie exacte de la méthylation de l'ADN dans les îles CpG est
nécessaire pour comprendre les diverses fonctions biologiques. Cependant, l'identification
précise des îlots de CpG à partir du génome entier par des approches expérimentales et
computationnelles reste difficile. De nombreuses méthodes de calcul sont développées pour
détecter les régions enrichies de CpG, de manière efficace, afin de réduire le temps et le coût
des expériences. Ici, nous passons en revue quelques-unes des dernières méthodes de
détection de CpG computationnelle qui utilisent le clustering, les modèles et les paramètres de
distance physique comme pour la détection d'île de CpG. Les analyses comparatives des
méthodes reposant sur différents principes et paramètres permettent de prioriser les
algorithmes pour des ensembles de données spécifiques CpG associés afin d'obtenir une plus
grande précision et sensibilité. Un certain nombre d'outils de calcul basés sur la fenêtre, les
algorithmes basés sur la densité et la distance / longueur sont appliqués sur le génome
humains pour la détection précise de CpG.Plusieurs algorithmes ont été développés pour
l'identification CGI et ont été appliqués dans de nombreuses études. Ils peuvent être classés en
deux groupes : les algorithmes traditionnels qui sont basés sur trois paramètres de séquence
(longueur, contenu GC, et rapport de la CpGs observée sur la CpGs attendue
( |
| Diplome : |
Master 2 |
| Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15205 |
Etude Comparative des Méthodes in Silico Etude Comparative des Méthodes in Silicopour la Détection des Ilots CpG. [texte imprimé] / Amira Zarour, Auteur ; Djihad Chelia, Auteur ; Amira Gherboudj, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 52 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français ( fre)
| Catégories : |
Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire
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| Tags : |
Bioinformatique épigénétique île CpG Génome humain algorithmes de
détection, Bioinformatique. |
| Index. décimale : |
730 Biochimie et biologie cellulaire |
| Résumé : |
Les îlots CpG sont généralement connues sous le nom de régions de régulation
épigénétique, en fonction des modifications de l'histone, de la méthylation et de l'activité du
promoteur. La cartographie exacte de la méthylation de l'ADN dans les îles CpG est
nécessaire pour comprendre les diverses fonctions biologiques. Cependant, l'identification
précise des îlots de CpG à partir du génome entier par des approches expérimentales et
computationnelles reste difficile. De nombreuses méthodes de calcul sont développées pour
détecter les régions enrichies de CpG, de manière efficace, afin de réduire le temps et le coût
des expériences. Ici, nous passons en revue quelques-unes des dernières méthodes de
détection de CpG computationnelle qui utilisent le clustering, les modèles et les paramètres de
distance physique comme pour la détection d'île de CpG. Les analyses comparatives des
méthodes reposant sur différents principes et paramètres permettent de prioriser les
algorithmes pour des ensembles de données spécifiques CpG associés afin d'obtenir une plus
grande précision et sensibilité. Un certain nombre d'outils de calcul basés sur la fenêtre, les
algorithmes basés sur la densité et la distance / longueur sont appliqués sur le génome
humains pour la détection précise de CpG.Plusieurs algorithmes ont été développés pour
l'identification CGI et ont été appliqués dans de nombreuses études. Ils peuvent être classés en
deux groupes : les algorithmes traditionnels qui sont basés sur trois paramètres de séquence
(longueur, contenu GC, et rapport de la CpGs observée sur la CpGs attendue
( |
| Diplome : |
Master 2 |
| Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15205 |
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