| Titre : |
Etude in silico de l’inhibition de la 3-chymotrypsin like protease en vue de combattre le syndrome respiratoire aigue severe (sras) |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Manel Oulmi, Auteur ; Mira Zoubiri, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse |
| Editeur : |
CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine |
| Année de publication : |
2021 |
| Importance : |
113 f. |
| Format : |
30 cm. |
| Note générale : |
Une copie electronique PDF disponible au BUC |
| Langues : |
Français (fre) |
| Catégories : |
Biologie:Biologie Appliquée
|
| Tags : |
COVID-19, 3CLpro, Docking moléculaire, Inhibiteur, Surflex, RMSD, ADMET,Biochimie Appliquée |
| Index. décimale : |
710 Biologie Appliquée |
| Résumé : |
La pandémie actuelle de COVID-19 a déclenché des efforts mondiaux pour l'identification rapide
des vaccins et des traitements antiviraux spécifiques. 3CLpro joue un rôle clé dans le cycle de vie de
la réplication et de la maturation du coronavirus. Le Docking moléculaire est une méthode souvent
utilisée dans les phases initiales du processus de développement de nouveaux médicaments. Nous
l’avons utilisé Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur
que « Ebselen » qui agit sur la cible 3CL pro. Le programme de docking moléculaire Surflex a été
développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs
de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 61% et un coefficient de corrélation de 0,610, les
performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la
superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Dans un deuxième
temps, nous avons complété nos essais par une modélisation structurale en effectuant 63 mono
substitutions et 42 bi-substitutions, parmi lesquelles quelques composés substitués ont eu des
affinités améliorées. Le meilleur composé n°47 parmi les mono substitués a atteint une affinité de 5.32
M-1 et les meilleurs composés bi substitués n°26 et n°24 avec des affinités respectives de 6.21 M-1 et
6.02M-1. Enfin, l’étude des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques et de toxicité potentielle
montrent que le composé B24 a présenté un meilleur profil ADMET, par son métabolisme, et faible
toxicité aigüe, contrairement au composé de référence et au composé qui a une plus grande valeur
d’affinité B26. Nous le proposons donc comme nouvel inhibiteur éventuel de la 3CL pro. |
| Diplome : |
Master 2 |
| Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15309 |
Etude in silico de l’inhibition de la 3-chymotrypsin like protease en vue de combattre le syndrome respiratoire aigue severe (sras) [texte imprimé] / Manel Oulmi, Auteur ; Mira Zoubiri, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 113 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français ( fre)
| Catégories : |
Biologie:Biologie Appliquée
|
| Tags : |
COVID-19, 3CLpro, Docking moléculaire, Inhibiteur, Surflex, RMSD, ADMET,Biochimie Appliquée |
| Index. décimale : |
710 Biologie Appliquée |
| Résumé : |
La pandémie actuelle de COVID-19 a déclenché des efforts mondiaux pour l'identification rapide
des vaccins et des traitements antiviraux spécifiques. 3CLpro joue un rôle clé dans le cycle de vie de
la réplication et de la maturation du coronavirus. Le Docking moléculaire est une méthode souvent
utilisée dans les phases initiales du processus de développement de nouveaux médicaments. Nous
l’avons utilisé Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur
que « Ebselen » qui agit sur la cible 3CL pro. Le programme de docking moléculaire Surflex a été
développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs
de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 61% et un coefficient de corrélation de 0,610, les
performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la
superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Dans un deuxième
temps, nous avons complété nos essais par une modélisation structurale en effectuant 63 mono
substitutions et 42 bi-substitutions, parmi lesquelles quelques composés substitués ont eu des
affinités améliorées. Le meilleur composé n°47 parmi les mono substitués a atteint une affinité de 5.32
M-1 et les meilleurs composés bi substitués n°26 et n°24 avec des affinités respectives de 6.21 M-1 et
6.02M-1. Enfin, l’étude des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques et de toxicité potentielle
montrent que le composé B24 a présenté un meilleur profil ADMET, par son métabolisme, et faible
toxicité aigüe, contrairement au composé de référence et au composé qui a une plus grande valeur
d’affinité B26. Nous le proposons donc comme nouvel inhibiteur éventuel de la 3CL pro. |
| Diplome : |
Master 2 |
| Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15309 |
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