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Auteur M.A Hamidechi |
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Titre : Analyse bioinformatique des variants de l’hémoglobine humaine Type de document : texte imprimé Auteurs : Yasmine Ziadi, Auteur ; Amira Sekehal, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2020 Importance : 55 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Mots clés : Hémoglobine – variant – Alignement – Structure 3D, Biochimie de la Nutrition. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : L’objectif principal de cette étude bioinformatique des molécules d’hémoglobine
humaine est de prédire les éventuelles mutations in silico par substitutions de certains résidus
amino-acides de la séquence native (non mutée) et de mesurer l’effet de cette mutation
ponctuelle sur l’activité de la protéine d’hémoglobine par comparaison aux mutations de
certains vertébrés choisi dans cette études (Taureau, rat et souris). Des résultats significatifs
ont été observés après avoir scanné les séquences substituées avec l’outil bioinformatique
PMut. Ainsi, une première substitution du résidu N par une cystéine et une deuxième
substitution du résidu D par un tryptophane ont causé des modifications conformationnelles
importante dans la structure 3D observée sur le logiciel PyMolDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=13935 Analyse bioinformatique des variants de l’hémoglobine humaine [texte imprimé] / Yasmine Ziadi, Auteur ; Amira Sekehal, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2020 . - 55 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible au BUC
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Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Mots clés : Hémoglobine – variant – Alignement – Structure 3D, Biochimie de la Nutrition. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : L’objectif principal de cette étude bioinformatique des molécules d’hémoglobine
humaine est de prédire les éventuelles mutations in silico par substitutions de certains résidus
amino-acides de la séquence native (non mutée) et de mesurer l’effet de cette mutation
ponctuelle sur l’activité de la protéine d’hémoglobine par comparaison aux mutations de
certains vertébrés choisi dans cette études (Taureau, rat et souris). Des résultats significatifs
ont été observés après avoir scanné les séquences substituées avec l’outil bioinformatique
PMut. Ainsi, une première substitution du résidu N par une cystéine et une deuxième
substitution du résidu D par un tryptophane ont causé des modifications conformationnelles
importante dans la structure 3D observée sur le logiciel PyMolDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=13935 Réservation
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texte intégreAdobe Acrobat PDFAnalyse de l’effet de quelques paramètres sur la production de matières protéiques à partir de Saccharomyces cerevisiae : le modèle complet équilibré / Lamia Mabrak
Titre : Analyse de l’effet de quelques paramètres sur la production de matières protéiques à partir de Saccharomyces cerevisiae : le modèle complet équilibré Type de document : texte imprimé Auteurs : Lamia Mabrak, Auteur ; Sameh Boukail, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2012 Importance : 41 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible en BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Saccharomyces cerevisiae plan factoriel complet méthode de Kjeldahl matière azotée protéines biochimie microbiologie. Index. décimale : 720 Microbiologie Résumé : Ce travail a pour but la production de protéines a partir de S. cerevisiae cultivé sous conditions de fermentation contrôlées.
Trois facteurs ont été sélectionnés: pH, volume du milieu réactionnel (mL) et la taille de l’inoculum (%), huit essais ont été réalisé afin d’optimiser les facteurs choisis.
Le plan choisi pour réaliser les expériences est un plan factoriel complet, utilisant le model mathématique linéaire avec interactions. L’équation model (y) de la quantité de protéines produite après la fermentation a été estimée comme suit :
y = 6,47. 10-2 + 1,11. 10-2 (pH) - 3,34. 10-2 (V) + 2,9. 10-2 (I) - 0,66. 10-2(pH/V) - 0,66. 10-2 (pH/ I) - 2,45. 10-2 (V/ I) + 0,22. 10-2 (pH/ V/ I)
La démarche de planification qui a été suivie se résume en une fermentation par S. cerevisiae sous conditions contrôlées, suivie d’un dosage de la matière azotée par la méthode de Kjeldahl et enfin une analyse de l’effet des paramètres (pH, milieu réactionnel et taille de l’inoculum) sur la production de la matière protéique par plan factoriel complet équilibré.
Il a été constaté que le rendement de S. cerevisiae est meilleur quand elle est soumise aux conditions d’un pH = 6, un volume du milieu réactionnel 15 mL et d’un poids d’inoculum de 5%. Cependant, la productivité est faible lorsque le pH est de 4, le volume du milieu réactionnel 15 mL et d’un poids d’inoculum de 1%.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=6525 Analyse de l’effet de quelques paramètres sur la production de matières protéiques à partir de Saccharomyces cerevisiae : le modèle complet équilibré [texte imprimé] / Lamia Mabrak, Auteur ; Sameh Boukail, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2012 . - 41 f. ; 30 cm.
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Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Saccharomyces cerevisiae plan factoriel complet méthode de Kjeldahl matière azotée protéines biochimie microbiologie. Index. décimale : 720 Microbiologie Résumé : Ce travail a pour but la production de protéines a partir de S. cerevisiae cultivé sous conditions de fermentation contrôlées.
Trois facteurs ont été sélectionnés: pH, volume du milieu réactionnel (mL) et la taille de l’inoculum (%), huit essais ont été réalisé afin d’optimiser les facteurs choisis.
Le plan choisi pour réaliser les expériences est un plan factoriel complet, utilisant le model mathématique linéaire avec interactions. L’équation model (y) de la quantité de protéines produite après la fermentation a été estimée comme suit :
y = 6,47. 10-2 + 1,11. 10-2 (pH) - 3,34. 10-2 (V) + 2,9. 10-2 (I) - 0,66. 10-2(pH/V) - 0,66. 10-2 (pH/ I) - 2,45. 10-2 (V/ I) + 0,22. 10-2 (pH/ V/ I)
La démarche de planification qui a été suivie se résume en une fermentation par S. cerevisiae sous conditions contrôlées, suivie d’un dosage de la matière azotée par la méthode de Kjeldahl et enfin une analyse de l’effet des paramètres (pH, milieu réactionnel et taille de l’inoculum) sur la production de la matière protéique par plan factoriel complet équilibré.
Il a été constaté que le rendement de S. cerevisiae est meilleur quand elle est soumise aux conditions d’un pH = 6, un volume du milieu réactionnel 15 mL et d’un poids d’inoculum de 5%. Cependant, la productivité est faible lorsque le pH est de 4, le volume du milieu réactionnel 15 mL et d’un poids d’inoculum de 1%.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=6525 Réservation
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Titre : Analyses phénétique et bioinformatique des isolats bactériens de deux sols cultivés de blé dur : Rôle de la structure 2D des ARNr 16S dans l’identification des isolats Type de document : texte imprimé Auteurs : Djaber Sayah, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2016 Importance : 46 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible en BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Ecologie microbienne Sol agricole ARNr 16S Structure 2D SDS-page BLAST. Index. décimale : 720 Microbiologie Résumé : Cette étude repose en premier lieu sur la caractérisation phénotypique classique (morphologie, biochimie et physiologie des isolats) suivie d’une analyse protéomique par la technique de SDS-page et enfin, corroborée par l’analyse bioinformatique des séquences 16S rRNA par la prédiction des structures 2D et la détermination des liens phylogénétiques. Ces techniques, apportent une valeur ajoutée dans l’identification bactérienne. La comparaison d’une séquence contre ces banques(BLAST) peut biaiser le résultat. Le résultat qui ressort de cette étude est la possibilité d’être face à trois germes nouveaux encore non identifiés sur toutes les bases de données. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3404 Analyses phénétique et bioinformatique des isolats bactériens de deux sols cultivés de blé dur : Rôle de la structure 2D des ARNr 16S dans l’identification des isolats [texte imprimé] / Djaber Sayah, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2016 . - 46 f. ; 30 cm.
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Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Ecologie microbienne Sol agricole ARNr 16S Structure 2D SDS-page BLAST. Index. décimale : 720 Microbiologie Résumé : Cette étude repose en premier lieu sur la caractérisation phénotypique classique (morphologie, biochimie et physiologie des isolats) suivie d’une analyse protéomique par la technique de SDS-page et enfin, corroborée par l’analyse bioinformatique des séquences 16S rRNA par la prédiction des structures 2D et la détermination des liens phylogénétiques. Ces techniques, apportent une valeur ajoutée dans l’identification bactérienne. La comparaison d’une séquence contre ces banques(BLAST) peut biaiser le résultat. Le résultat qui ressort de cette étude est la possibilité d’être face à trois germes nouveaux encore non identifiés sur toutes les bases de données. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3404 Exemplaires (1)
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Titre : Caractérisation des bactéries isolées d’un sol destiné à la culture céréalière : Approches phénotypique et Bioinformatique Type de document : texte imprimé Auteurs : Wassila Boulekzaz, Auteur ; Meriem Bouderbala, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2015 Importance : 59 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie électronique PDF disponible en BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Sol agricole ARNr 16S Prédiction Structure 2D Phylogénie. Index. décimale : 720 Microbiologie Résumé : L’objectif de ce travail est de proposer une approche double phasique pour l’identification des
bactéries isolées d’un sol destiné à la production céréalière.
Ces deux phases sont la caractérisation phénotypique classique (morphologie, biochimie et
physiologie des isolats) et l’analyse bioinformatique des séquences 16S par la prédiction des
structures 2D des ARNr 16S et la détermination des liens phylogénétiques.
Les résultats des deux méthodes sont en accord. Les souches isolées sont : Salmonella sp.,
Chromobacterium violaceum, Pseudomonas fluorescens, Enterobacter aerogenes et Enterobacter
intermedius.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=8990 Caractérisation des bactéries isolées d’un sol destiné à la culture céréalière : Approches phénotypique et Bioinformatique [texte imprimé] / Wassila Boulekzaz, Auteur ; Meriem Bouderbala, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2015 . - 59 f. ; 30 cm.
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Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Sol agricole ARNr 16S Prédiction Structure 2D Phylogénie. Index. décimale : 720 Microbiologie Résumé : L’objectif de ce travail est de proposer une approche double phasique pour l’identification des
bactéries isolées d’un sol destiné à la production céréalière.
Ces deux phases sont la caractérisation phénotypique classique (morphologie, biochimie et
physiologie des isolats) et l’analyse bioinformatique des séquences 16S par la prédiction des
structures 2D des ARNr 16S et la détermination des liens phylogénétiques.
Les résultats des deux méthodes sont en accord. Les souches isolées sont : Salmonella sp.,
Chromobacterium violaceum, Pseudomonas fluorescens, Enterobacter aerogenes et Enterobacter
intermedius.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=8990 Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MSBIO150159 MSBIO150159 Document électronique Bibliothèque principale Mémoires Disponible Documents numériques
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Titre : Incidence de Staphylococcus sp. dans les affections bovines : Prédiction des structures 2D du gène rRNA 16S pour le diagnostic bactérien Type de document : texte imprimé Auteurs : Chemseddine Kadri, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2016 Importance : 70 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible en BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Staphylococcus ARNr 16S Structure 2D SDS-PAGE Ecologie microbienne. Index. décimale : 750 Biologie Animale Résumé : L'objectif de ce travail est de proposer une approche combinée (phénotypique et biomoléculaire)
pour la caractérisation des Staphylocoques isolées des bovins.
Ces phases sont la caractérisation phénotypique classique (morphologie, biochimie et
physiologie des isolats), phase génotypique par séquençage du gène 16S et une analyse protéomique
des isolats par une électrophorèse SDS-PAGE ainsi que l'analyse bioinformatique des séquences
16S par prédiction des structures 2D des ARNr 16S et la détermination des liens phylogénétiques.
Les souche isolées sont : Staphylococcus haemolyticus et Macrococcus brunensis.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3478 Incidence de Staphylococcus sp. dans les affections bovines : Prédiction des structures 2D du gène rRNA 16S pour le diagnostic bactérien [texte imprimé] / Chemseddine Kadri, Auteur ; M.A Hamidechi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2016 . - 70 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible en BUC.
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Catégories : Biologie:Microbiologie Tags : Staphylococcus ARNr 16S Structure 2D SDS-PAGE Ecologie microbienne. Index. décimale : 750 Biologie Animale Résumé : L'objectif de ce travail est de proposer une approche combinée (phénotypique et biomoléculaire)
pour la caractérisation des Staphylocoques isolées des bovins.
Ces phases sont la caractérisation phénotypique classique (morphologie, biochimie et
physiologie des isolats), phase génotypique par séquençage du gène 16S et une analyse protéomique
des isolats par une électrophorèse SDS-PAGE ainsi que l'analyse bioinformatique des séquences
16S par prédiction des structures 2D des ARNr 16S et la détermination des liens phylogénétiques.
Les souche isolées sont : Staphylococcus haemolyticus et Macrococcus brunensis.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3478 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MSBIO160050 MSBIO160050 Livre Bibliothèque principale Albums Enfants Exclu du prêt Documents numériques
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