SARS-COV 2 Variants and Geo-localization Tracking / Mohamed el Amine Sayad 

Public ISBD Titre : SARS-COV 2 Variants and Geo-localization Tracking : A New Deep-learning Approach. Type de document : texte imprimé Auteurs : Mohamed el Amine Sayad, Auteur ; Raid Serrar, Auteur ; H Chehili, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2021 Importance : 56 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Anglais (eng) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Deep learning  detecting  variants  geographic  preprocessing,Bioinformatics. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : On January 30, 2020, the World Health Organization declared the SARS-CoV-2 epidemic a public health emergency of international concern, detecting emerged variants and tracking them geographically stays a big challenge for the scientific community due to the massive increase in genomic data generated from extensive sequencing of the virus. This study aims to propose two deep learning models with k-mer preprocessing that can handle and analyze these data, to extract features to identify variants and geographic patterns of their evolution. As a result, the first model exceeded state-of-the-art results while, the second model achieved state-of-the-art results. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15745 SARS-COV 2 Variants and Geo-localization Tracking : A New Deep-learning Approach. [texte imprimé] / Mohamed el Amine Sayad, Auteur ; Raid Serrar, Auteur ; H Chehili, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 56 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Anglais (eng) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Deep learning  detecting  variants  geographic  preprocessing,Bioinformatics. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : On January 30, 2020, the World Health Organization declared the SARS-CoV-2 epidemic a public health emergency of international concern, detecting emerged variants and tracking them geographically stays a big challenge for the scientific community due to the massive increase in genomic data generated from extensive sequencing of the virus. This study aims to propose two deep learning models with k-mer preprocessing that can handle and analyze these data, to extract features to identify variants and geographic patterns of their evolution. As a result, the first model exceeded state-of-the-art results while, the second model achieved state-of-the-art results. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15745

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Traitement des données générées par le séquençage NGS du génome du SARS-CoV-2. / Imène Meliani 

Public ISBD Titre : Traitement des données générées par le séquençage NGS du génome du SARS-CoV-2. Type de document : texte imprimé Auteurs : Imène Meliani, Auteur ; Imene Boudemagh, Auteur ; H Chehili, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2021 Importance : 79 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : COVID-19, SARS-CoV-2, pipelines, outils, variants,Bio-informatique Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Depuis décembre 2019, une maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) est apparue à Wuhan et devient par la suite une épidémie mondiale. Cette dernière a stressé le monde entier, elle a obligé les chercheurs à faire des efforts pour étudier ce virus qui s’est propagé rapidement, provoquant une morbidité et mortalité importantes, ce qui a incité beaucoup de laboratoires de recherches et des universités à séquencer le génome de ce virus et disposer des pipelines spécifiques pour faire des analyses et des interprétations qui nous aides à lutter contre cette urgence sanitaire la plus difficiles. Cette étude a comme objectif être capable au futur de traiter des données séquencées du SARS-CoV-2 en Algérie. Nous avons créé notre propre pipeline en utilisant des logiciels et outils libres d’accès pour faire des essais sur des séquences qui sont déjà séquencées par Illumina et Ion Torrent et traiter par d’autres pipelines et comparer les résultats après avoir détecté les variants. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15270 Traitement des données générées par le séquençage NGS du génome du SARS-CoV-2. [texte imprimé] / Imène Meliani, Auteur ; Imene Boudemagh, Auteur ; H Chehili, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 79 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : COVID-19, SARS-CoV-2, pipelines, outils, variants,Bio-informatique Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Depuis décembre 2019, une maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) est apparue à Wuhan et devient par la suite une épidémie mondiale. Cette dernière a stressé le monde entier, elle a obligé les chercheurs à faire des efforts pour étudier ce virus qui s’est propagé rapidement, provoquant une morbidité et mortalité importantes, ce qui a incité beaucoup de laboratoires de recherches et des universités à séquencer le génome de ce virus et disposer des pipelines spécifiques pour faire des analyses et des interprétations qui nous aides à lutter contre cette urgence sanitaire la plus difficiles. Cette étude a comme objectif être capable au futur de traiter des données séquencées du SARS-CoV-2 en Algérie. Nous avons créé notre propre pipeline en utilisant des logiciels et outils libres d’accès pour faire des essais sur des séquences qui sont déjà séquencées par Illumina et Ion Torrent et traiter par d’autres pipelines et comparer les résultats après avoir détecté les variants. Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15270

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