Titre : |
Inhibition in silico de l’ARN polyméraseNS5B pour combattre le virus de l’hépatite C |
Type de document : |
texte imprimé |
Auteurs : |
Kaouther Chikhi, Auteur ; Oumeima Ayadi, Auteur ; E.H. MOKRANI, Directeur de thèse |
Editeur : |
CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine |
Année de publication : |
2016 |
Importance : |
50 f. |
Format : |
30 cm. |
Note générale : |
Une copie electronique PDF disponible en BUC |
Langues : |
Français (fre) |
Catégories : |
Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire
|
Tags : |
Docking moléculaire Surflex-dock RMSD, coefficient de corrélation l’ARN polymérase
NS5B Hépatite C substitutions Biochimie Moléculaire et Santé. |
Index. décimale : |
730 Biochimie et biologie cellulaire |
Résumé : |
L’hépatite C est une inflammation du foie provoquée par le virus VHC pour laquelle les chercheurs
n’ont pu mettre au point ni vaccin ni traitement efficace jusqu’à aujourd’hui. Récemment, le sofosbuvir, un
inhibiteur de l’ARN polymérase NS5B, a été mis sur le marché comme traitement de l’hépatite C.
Cependant, les limites de ce traitement en termes d’efficacité et d’effets indésirables imposent de
développer de nouvelles molécules.
Dans cette optique, nous avons effectué plusieurs substitutions du Sofosbuvir afin d’étudier
l’inhibition de l’ARN polymérase NS5B ainsi que leur mode d’interaction avec cette enzyme en utilisant la
technique du docking moléculaire via le programme Surflex. Auparavant, nous avions testé l’efficacité de
ce logiciel à travers une expérimentation qui a donné plus de 82% des valeurs du RMSD inférieures à 2 Å et
un coefficient de corrélation de l’ordre de 0.52, ce qui est jugé assez performant. Le logiciel peut donc être
utilisé en toute confiance pour l’étude des différentes structures moléculaires retenues dans ce travail.
En effet, nous avons effectué 36 mono substitutions et 20 bi substitutions. par ce fait, nous avons
remarqué une amélioration significative de l'affinité par rapport à celle de la molécule de base qui était de
(5,52 M-1).
Parmi ces composés présentant des affinités supérieures à celle du Sofosbuvir nous avons choisi les
meilleurs à savoir les composés (N° 04, 26, 27,17, 37 et 53) qui ont des affinités respectives de (10,37 ;
9,07 ; 10,46 ; 9,06 ; 7,72 ; 8,30 M-1) pour évaluer les paramètres permettant leur validation comme
inhibiteurs de l’enzyme.
L’application de la règle de 5 de Lipinski nous a permis de proposer 4 molécules parmi les substituants
obtenus et que nous recommandons comme des inhibiteurs potentiellement plus actifs que le Sofosbuvir.
Leur validation en tant que nouveaux composés antiviraux reste, cependant, tributaire de tests
complémentaires in vitro et in vivo. |
Diplome : |
Master 2 |
Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3692 |
Inhibition in silico de l’ARN polyméraseNS5B pour combattre le virus de l’hépatite C [texte imprimé] / Kaouther Chikhi, Auteur ; Oumeima Ayadi, Auteur ; E.H. MOKRANI, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2016 . - 50 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible en BUC Langues : Français ( fre)
Catégories : |
Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire
|
Tags : |
Docking moléculaire Surflex-dock RMSD, coefficient de corrélation l’ARN polymérase
NS5B Hépatite C substitutions Biochimie Moléculaire et Santé. |
Index. décimale : |
730 Biochimie et biologie cellulaire |
Résumé : |
L’hépatite C est une inflammation du foie provoquée par le virus VHC pour laquelle les chercheurs
n’ont pu mettre au point ni vaccin ni traitement efficace jusqu’à aujourd’hui. Récemment, le sofosbuvir, un
inhibiteur de l’ARN polymérase NS5B, a été mis sur le marché comme traitement de l’hépatite C.
Cependant, les limites de ce traitement en termes d’efficacité et d’effets indésirables imposent de
développer de nouvelles molécules.
Dans cette optique, nous avons effectué plusieurs substitutions du Sofosbuvir afin d’étudier
l’inhibition de l’ARN polymérase NS5B ainsi que leur mode d’interaction avec cette enzyme en utilisant la
technique du docking moléculaire via le programme Surflex. Auparavant, nous avions testé l’efficacité de
ce logiciel à travers une expérimentation qui a donné plus de 82% des valeurs du RMSD inférieures à 2 Å et
un coefficient de corrélation de l’ordre de 0.52, ce qui est jugé assez performant. Le logiciel peut donc être
utilisé en toute confiance pour l’étude des différentes structures moléculaires retenues dans ce travail.
En effet, nous avons effectué 36 mono substitutions et 20 bi substitutions. par ce fait, nous avons
remarqué une amélioration significative de l'affinité par rapport à celle de la molécule de base qui était de
(5,52 M-1).
Parmi ces composés présentant des affinités supérieures à celle du Sofosbuvir nous avons choisi les
meilleurs à savoir les composés (N° 04, 26, 27,17, 37 et 53) qui ont des affinités respectives de (10,37 ;
9,07 ; 10,46 ; 9,06 ; 7,72 ; 8,30 M-1) pour évaluer les paramètres permettant leur validation comme
inhibiteurs de l’enzyme.
L’application de la règle de 5 de Lipinski nous a permis de proposer 4 molécules parmi les substituants
obtenus et que nous recommandons comme des inhibiteurs potentiellement plus actifs que le Sofosbuvir.
Leur validation en tant que nouveaux composés antiviraux reste, cependant, tributaire de tests
complémentaires in vitro et in vivo. |
Diplome : |
Master 2 |
Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=3692 |
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