| Titre : |
Recherche de nouveaux inhibiteurs d’Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase par la méthode du docking moléculaire |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Wahida Guerfi, Auteur ; Meriem Cherifi, Auteur ; E.H. MOKRANI, Directeur de thèse |
| Editeur : |
CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine |
| Année de publication : |
2016 |
| Importance : |
49 f. |
| Format : |
30 cm. |
| Note générale : |
Une copie electronique PDF disponible en BUC. |
| Langues : |
Français (fre) |
| Catégories : |
Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire
|
| Tags : |
Interaction protéine-ligand, Docking moléculaire, Surflex, RMSD, Le coefficient de
corrélation Affinité Escherichia coli undecaprenyl pyrophosphate synthase Peptidoglycane
bactérien Biochimie moléculaire et santé. |
| Index. décimale : |
730 Biochimie et biologie cellulaire |
| Résumé : |
L’étude des interactions protéine – ligand et le docking moléculaire représentent des
techniques performantes dans la modélisation de l’activité biologique. Le docking moléculaire
vise à prédire la structure d’un complexe à partir de molécules isolées.
Le programme d’arrimage moléculaire Surflex-dock a été développé pour aider à la mise
au point de molécules à activité thérapeutique . Avec un taux de valeurs de RMSD
inférieures à 2 Å de 82.08%, les performances du programme Surflex-dock sont
incontestables.
La suite de notre étude consiste à rechercher de meilleurs inhibiteurs d’Escherichia.coli
undecaprenyl pyrophosphate synthase, une enzyme qui catalyse la formation du support
lipidique, élément essentiel pour la biosynthèse du peptidoglycane bactérien.
Nous avons testé dans ce but 200 similaires de l’inhibiteur retenu ou de référence, le composé
53Q. Les résultats du docking montrent que les affinités des 3 similaires : CID_5702023 (5,84 M-
1
), CID_15819119 (5,01 M-1) et CID_11771109 (4.98 M-1) sont supérieures à celle du 53Q (1.78
M-1).
De ce fait, nous proposons ces trois composés comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de
l’enzyme Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase, cependant des tests in vitro et
in vivo sont indispensables pour valider ces résultats.
Il faut enfin noter que tous ces composés proposés possèdent des propriétés pharmacologiques
appropriées qui sont en conformité avec les critères imposés par la règle de Lipinski |
| Diplome : |
Master 2 |
| Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=8606 |
Recherche de nouveaux inhibiteurs d’Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase par la méthode du docking moléculaire [texte imprimé] / Wahida Guerfi, Auteur ; Meriem Cherifi, Auteur ; E.H. MOKRANI, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2016 . - 49 f. ; 30 cm. Une copie electronique PDF disponible en BUC. Langues : Français ( fre)
| Catégories : |
Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire
|
| Tags : |
Interaction protéine-ligand, Docking moléculaire, Surflex, RMSD, Le coefficient de
corrélation Affinité Escherichia coli undecaprenyl pyrophosphate synthase Peptidoglycane
bactérien Biochimie moléculaire et santé. |
| Index. décimale : |
730 Biochimie et biologie cellulaire |
| Résumé : |
L’étude des interactions protéine – ligand et le docking moléculaire représentent des
techniques performantes dans la modélisation de l’activité biologique. Le docking moléculaire
vise à prédire la structure d’un complexe à partir de molécules isolées.
Le programme d’arrimage moléculaire Surflex-dock a été développé pour aider à la mise
au point de molécules à activité thérapeutique . Avec un taux de valeurs de RMSD
inférieures à 2 Å de 82.08%, les performances du programme Surflex-dock sont
incontestables.
La suite de notre étude consiste à rechercher de meilleurs inhibiteurs d’Escherichia.coli
undecaprenyl pyrophosphate synthase, une enzyme qui catalyse la formation du support
lipidique, élément essentiel pour la biosynthèse du peptidoglycane bactérien.
Nous avons testé dans ce but 200 similaires de l’inhibiteur retenu ou de référence, le composé
53Q. Les résultats du docking montrent que les affinités des 3 similaires : CID_5702023 (5,84 M-
1
), CID_15819119 (5,01 M-1) et CID_11771109 (4.98 M-1) sont supérieures à celle du 53Q (1.78
M-1).
De ce fait, nous proposons ces trois composés comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de
l’enzyme Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase, cependant des tests in vitro et
in vivo sont indispensables pour valider ces résultats.
Il faut enfin noter que tous ces composés proposés possèdent des propriétés pharmacologiques
appropriées qui sont en conformité avec les critères imposés par la règle de Lipinski |
| Diplome : |
Master 2 |
| Permalink : |
https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=8606 |
|
Recherche de nouveaux inhibiteurs d’Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase par la méthode du docking moléculaire
