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Contribution à la mise en évidence de nouveauxinhibiteurs de la Protéine Tyrosine Phosphatase 1B par docking moléculaire / Amina Chaalal
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Titre : Contribution à la mise en évidence de nouveauxinhibiteurs de la Protéine Tyrosine Phosphatase 1B par docking moléculaire Type de document : texte imprimé Auteurs : Amina Chaalal, Auteur ; Chahinez Fatmi, Auteur ; A Bensegueni, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2017 Importance : 69 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible en BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Docking moléculaire Surflex PTP1B Diabète Inhibiteur affinité Lipinski Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Notre travail permet de rechercher de nouveaux inhibiteurs de la PTP1B, cible valide pour
le traitement de la maladie de diabète de type 2.Nous avons utilisé le programme de docking
moléculaire Surflex, après la confirmation de sa fiabilité par les 3 tests : le RMSD, l’analyse
visuelle et le coefficient de corrélation.
Le docking a été réalisé sur 55 similaires. Les résultats montrent que les affinités des
similaires CID_44265877 (5.64), CID_18398718 (5.34), CID_18398702 (5.11), CID_59892044
(4.93), CID_23646466 (4.44) sont supérieurs à celle du composé 1, de ce fait nous proposons
ces similaires comme de nouveaux inhibiteurs de la PTP1B.
On a fini le travail par la règle de 5 de Lipinski pour affirmer que tous ces composés
possèdent des propriétés pharmacocinétiques ADME positifsDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=4940 Contribution à la mise en évidence de nouveauxinhibiteurs de la Protéine Tyrosine Phosphatase 1B par docking moléculaire [texte imprimé] / Amina Chaalal, Auteur ; Chahinez Fatmi, Auteur ; A Bensegueni, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2017 . - 69 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible en BUC
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Docking moléculaire Surflex PTP1B Diabète Inhibiteur affinité Lipinski Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Notre travail permet de rechercher de nouveaux inhibiteurs de la PTP1B, cible valide pour
le traitement de la maladie de diabète de type 2.Nous avons utilisé le programme de docking
moléculaire Surflex, après la confirmation de sa fiabilité par les 3 tests : le RMSD, l’analyse
visuelle et le coefficient de corrélation.
Le docking a été réalisé sur 55 similaires. Les résultats montrent que les affinités des
similaires CID_44265877 (5.64), CID_18398718 (5.34), CID_18398702 (5.11), CID_59892044
(4.93), CID_23646466 (4.44) sont supérieurs à celle du composé 1, de ce fait nous proposons
ces similaires comme de nouveaux inhibiteurs de la PTP1B.
On a fini le travail par la règle de 5 de Lipinski pour affirmer que tous ces composés
possèdent des propriétés pharmacocinétiques ADME positifsDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=4940 Réservation
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texte intégreAdobe Acrobat PDFPurification et caractérisation partielles et effet anti-inflammatoire des lectines extraites du champignon « Agrocybe Aegerita » / Manel Ghomrani
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Titre : Purification et caractérisation partielles et effet anti-inflammatoire des lectines extraites du champignon « Agrocybe Aegerita » Type de document : texte imprimé Auteurs : Manel Ghomrani, Auteur ; A Zitouni, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2018 Importance : 96 f. Format : 30 cm. Note générale : UNE COPIE ELECTRONIQUE PDF DISPONIBLE AU BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : : Lectines affinité Agglutination Purification. Biochimie Appliquée. Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Les lectines sont des protéines ou des glycoprotéines ubiquitaires, multivalentes de nature
non-immunitaires qui sont capables de reconnaitre et se lier spécifiquement et de
manière réversible aux fractions glucidiques des hydrates de carbone complexes sans
modifier la structure covalente des ligands glycosylés reconnus, qui provoquent dans
certains cas l’agglutination des érythrocytes.
Les champignons y compris les moisissures appartiennent à une division importante
d’organismes et elles présentent un large éventail d'activités biologiques importantes
pour le fonctionnement de la cellule et de l'organisme entier, et en raison de la haute
spécificité de la liaison réversible aux hydrates de carbone, elles sont des outils précieux
largement utilisés en biologie et en médecine et aussi en diverses applications
biotechnologiques.
Ici, nous passons en revue et analysons avec une caractérisation partielle ce qui est
actuellement connu sur les lectines isolées à partir du champignon
« AgrocybeAegerita »dit Pholiote du peuplier, y compris leur localisation, leurs propriétés
et leurs spécificités glucidiques.
Ces protéines ont été extraites et soumises à plusieurs tests afin d’y rechercher une
activité hémagglutinante, rendre compte de leur pHi, leur thermo-stabilité et leurs
interactions et affinités avec les sucres. Elles ont ensuite été partiellement purifiées Ã
l’aide d’une chromatographie sur gel d’exclusion. La pureté de la lectine ensuite a été
vérifiée par une (SDS-PAGE) dans des conditions dénaturantes.
Les effets anti-inflammatoires du champignon « AgrocybeAegerita » ont été évalués sur
les rats wistar de poids allant de 200 Ã 220 grammes.
L’extrait brut du champignon est administré par voie intra péritonéale 30 minutes avant
l'induction de l’inflammation (l'œdème du pied) par 0.1ml de formaldéhyde à 2%, la
drogue de référence est un anti-inflammatoire le ‘’Diclofenac‘’25mg.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=9766 Purification et caractérisation partielles et effet anti-inflammatoire des lectines extraites du champignon « Agrocybe Aegerita » [texte imprimé] / Manel Ghomrani, Auteur ; A Zitouni, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2018 . - 96 f. ; 30 cm.
UNE COPIE ELECTRONIQUE PDF DISPONIBLE AU BUC
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : : Lectines affinité Agglutination Purification. Biochimie Appliquée. Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Les lectines sont des protéines ou des glycoprotéines ubiquitaires, multivalentes de nature
non-immunitaires qui sont capables de reconnaitre et se lier spécifiquement et de
manière réversible aux fractions glucidiques des hydrates de carbone complexes sans
modifier la structure covalente des ligands glycosylés reconnus, qui provoquent dans
certains cas l’agglutination des érythrocytes.
Les champignons y compris les moisissures appartiennent à une division importante
d’organismes et elles présentent un large éventail d'activités biologiques importantes
pour le fonctionnement de la cellule et de l'organisme entier, et en raison de la haute
spécificité de la liaison réversible aux hydrates de carbone, elles sont des outils précieux
largement utilisés en biologie et en médecine et aussi en diverses applications
biotechnologiques.
Ici, nous passons en revue et analysons avec une caractérisation partielle ce qui est
actuellement connu sur les lectines isolées à partir du champignon
« AgrocybeAegerita »dit Pholiote du peuplier, y compris leur localisation, leurs propriétés
et leurs spécificités glucidiques.
Ces protéines ont été extraites et soumises à plusieurs tests afin d’y rechercher une
activité hémagglutinante, rendre compte de leur pHi, leur thermo-stabilité et leurs
interactions et affinités avec les sucres. Elles ont ensuite été partiellement purifiées Ã
l’aide d’une chromatographie sur gel d’exclusion. La pureté de la lectine ensuite a été
vérifiée par une (SDS-PAGE) dans des conditions dénaturantes.
Les effets anti-inflammatoires du champignon « AgrocybeAegerita » ont été évalués sur
les rats wistar de poids allant de 200 Ã 220 grammes.
L’extrait brut du champignon est administré par voie intra péritonéale 30 minutes avant
l'induction de l’inflammation (l'œdème du pied) par 0.1ml de formaldéhyde à 2%, la
drogue de référence est un anti-inflammatoire le ‘’Diclofenac‘’25mg.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=9766 Réservation
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texte intégreAdobe Acrobat PDFRecherche de nouveaux inhibiteurs d’Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase par la méthode du docking moléculaire / Wahida Guerfi
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Titre : Recherche de nouveaux inhibiteurs d’Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase par la méthode du docking moléculaire Type de document : texte imprimé Auteurs : Wahida Guerfi, Auteur ; Meriem Cherifi, Auteur ; E.H. MOKRANI, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2016 Importance : 49 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible en BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Interaction protéine-ligand, Docking moléculaire, Surflex, RMSD, Le coefficient de
corrélation Affinité Escherichia coli undecaprenyl pyrophosphate synthase Peptidoglycane
bactérien Biochimie moléculaire et santé.Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : L’étude des interactions protéine – ligand et le docking moléculaire représentent des
techniques performantes dans la modélisation de l’activité biologique. Le docking moléculaire
vise à prédire la structure d’un complexe à partir de molécules isolées.
Le programme d’arrimage moléculaire Surflex-dock a été développé pour aider à la mise
au point de molécules à activité thérapeutique . Avec un taux de valeurs de RMSD
inférieures à 2 Å de 82.08%, les performances du programme Surflex-dock sont
incontestables.
La suite de notre étude consiste à rechercher de meilleurs inhibiteurs d’Escherichia.coli
undecaprenyl pyrophosphate synthase, une enzyme qui catalyse la formation du support
lipidique, élément essentiel pour la biosynthèse du peptidoglycane bactérien.
Nous avons testé dans ce but 200 similaires de l’inhibiteur retenu ou de référence, le composé
53Q. Les résultats du docking montrent que les affinités des 3 similaires : CID_5702023 (5,84 M-
1
), CID_15819119 (5,01 M-1) et CID_11771109 (4.98 M-1) sont supérieures à celle du 53Q (1.78
M-1).
De ce fait, nous proposons ces trois composés comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de
l’enzyme Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase, cependant des tests in vitro et
in vivo sont indispensables pour valider ces résultats.
Il faut enfin noter que tous ces composés proposés possèdent des propriétés pharmacologiques
appropriées qui sont en conformité avec les critères imposés par la règle de LipinskiDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=8606 Recherche de nouveaux inhibiteurs d’Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase par la méthode du docking moléculaire [texte imprimé] / Wahida Guerfi, Auteur ; Meriem Cherifi, Auteur ; E.H. MOKRANI, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2016 . - 49 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible en BUC.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Interaction protéine-ligand, Docking moléculaire, Surflex, RMSD, Le coefficient de
corrélation Affinité Escherichia coli undecaprenyl pyrophosphate synthase Peptidoglycane
bactérien Biochimie moléculaire et santé.Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : L’étude des interactions protéine – ligand et le docking moléculaire représentent des
techniques performantes dans la modélisation de l’activité biologique. Le docking moléculaire
vise à prédire la structure d’un complexe à partir de molécules isolées.
Le programme d’arrimage moléculaire Surflex-dock a été développé pour aider à la mise
au point de molécules à activité thérapeutique . Avec un taux de valeurs de RMSD
inférieures à 2 Å de 82.08%, les performances du programme Surflex-dock sont
incontestables.
La suite de notre étude consiste à rechercher de meilleurs inhibiteurs d’Escherichia.coli
undecaprenyl pyrophosphate synthase, une enzyme qui catalyse la formation du support
lipidique, élément essentiel pour la biosynthèse du peptidoglycane bactérien.
Nous avons testé dans ce but 200 similaires de l’inhibiteur retenu ou de référence, le composé
53Q. Les résultats du docking montrent que les affinités des 3 similaires : CID_5702023 (5,84 M-
1
), CID_15819119 (5,01 M-1) et CID_11771109 (4.98 M-1) sont supérieures à celle du 53Q (1.78
M-1).
De ce fait, nous proposons ces trois composés comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de
l’enzyme Escherichia.coli undecaprenyl pyrophosphate synthase, cependant des tests in vitro et
in vivo sont indispensables pour valider ces résultats.
Il faut enfin noter que tous ces composés proposés possèdent des propriétés pharmacologiques
appropriées qui sont en conformité avec les critères imposés par la règle de LipinskiDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=8606 Réservation
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Titre : Caractérisation partielle des lectines de psalliote jaunissante : Agaricus xanthodermus Type de document : texte imprimé Auteurs : Dalel Bouzergui, Auteur ; Houda Hamames, Auteur ; Affef Zitouni, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2017 Importance : 92 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie électronique PDF disponible en BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Lectines glycoprotéines Agaricus Xanthodermus activité hémagglutinante monosaccharides inhibition affinité purification. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Les lectines sont des glycoprotéines ubiquitaires, polyvalentes d’origine non-immunitaire,
elles reconnaissent spécifiquement certaines structures oligosaccharidiques.
Le but de ce travail est de détecter la présence de lectines dans les extraits du champignon
toxique« Agaricus Xanthodermus » communément appelé psalliote jaunissante.
Dans notre étude, nous avons commencé par extraire en premier lieu les lectines tout en mettant en
évidence leur activité hémagglutinante, cette dernière est stable dans un intervalle de pH allant de 2
jusqu’à 12.
Le traitement thermique de ces lectines révèle une thermo-résistance pouvant atteindre 100°C.
Un test d’inhibition a été réalisé par la suite avec différents monosaccharides et une glycoprotéine et a
montré que nos lectines présentent une affinité pour le glucose, le lactose et le saccharose.
La purification de nos protéines est faite par chromatographie échangeuse d’anions sur gel de DEAE -
Cellulose, et à révéler l’existence probable de trois (3) sous-unités dans la SDS-PAGE, la première
est un monomère dont la masse moléculaire est de 150 KDa et l’autre est un dimère de 100 KDA dont
la masse moléculaire de chaque sous-unité est de 50 KDa.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=4958 Caractérisation partielle des lectines de psalliote jaunissante : Agaricus xanthodermus [texte imprimé] / Dalel Bouzergui, Auteur ; Houda Hamames, Auteur ; Affef Zitouni, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2017 . - 92 f. ; 30 cm.
Une copie électronique PDF disponible en BUC.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Lectines glycoprotéines Agaricus Xanthodermus activité hémagglutinante monosaccharides inhibition affinité purification. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Les lectines sont des glycoprotéines ubiquitaires, polyvalentes d’origine non-immunitaire,
elles reconnaissent spécifiquement certaines structures oligosaccharidiques.
Le but de ce travail est de détecter la présence de lectines dans les extraits du champignon
toxique« Agaricus Xanthodermus » communément appelé psalliote jaunissante.
Dans notre étude, nous avons commencé par extraire en premier lieu les lectines tout en mettant en
évidence leur activité hémagglutinante, cette dernière est stable dans un intervalle de pH allant de 2
jusqu’à 12.
Le traitement thermique de ces lectines révèle une thermo-résistance pouvant atteindre 100°C.
Un test d’inhibition a été réalisé par la suite avec différents monosaccharides et une glycoprotéine et a
montré que nos lectines présentent une affinité pour le glucose, le lactose et le saccharose.
La purification de nos protéines est faite par chromatographie échangeuse d’anions sur gel de DEAE -
Cellulose, et à révéler l’existence probable de trois (3) sous-unités dans la SDS-PAGE, la première
est un monomère dont la masse moléculaire est de 150 KDa et l’autre est un dimère de 100 KDA dont
la masse moléculaire de chaque sous-unité est de 50 KDa.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=4958 Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MSBIO170090 MSBIO170090 Document électronique Bibliothèque principale Mémoires Disponible Documents numériques
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MSBIO170090Adobe Acrobat PDFContribution à l’amélioration de l’activitébiologique des alcaloïdes dans l’inhibitionde la télomérase par docking moléculaire / Med Larbi Abdallah Chaouche
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Titre : Contribution à l’amélioration de l’activitébiologique des alcaloïdes dans l’inhibitionde la télomérase par docking moléculaire Type de document : texte imprimé Auteurs : Med Larbi Abdallah Chaouche, Auteur ; Teniou S, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2014 Importance : 79 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible en BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Télomérase Alcaloïdes Docking Inhibition Surflex Affinité Biochimie Moléculaire et Santé. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : La télomérase représente une cible importante pour les traitements anticancéreux, son
inhibition entraînant la mort des cellules cancéreuses. Plusieurs alcaloïdes ont montré une
activité anticancéreuse en inhibant cette enzyme. Dans ce contexte, le programme Surflex a
été utilisé afin d’évaluer l’activité biologique (inhibition) de la télomérase, par cinq molécules
d’alcaloïdes "dérivés des acridines" : Le dérivé 12 présentant l'IC50 le plus bas (1 .35 μM), a
donné par simulation avec Surflex la meilleure affinité d'interaction (2.21 M-1). En fin nous
avons développé un nouveau dérivé plus puissant que le dérivé12, le changement du radicale
NR2 du dérivé augmente nettement l'affinité qui passe de 2,21 M-1
à 3,87 M-1. L’application
de la règle de 5 de Lipinski nous renseigne de manière positive sur les propriétés ADME de
cette nouvelle molécule théorique qui se présente comme un inhibiteur potentiellement plus
actif que les cinq alcaloïdes.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=5925 Contribution à l’amélioration de l’activitébiologique des alcaloïdes dans l’inhibitionde la télomérase par docking moléculaire [texte imprimé] / Med Larbi Abdallah Chaouche, Auteur ; Teniou S, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2014 . - 79 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible en BUC
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Télomérase Alcaloïdes Docking Inhibition Surflex Affinité Biochimie Moléculaire et Santé. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : La télomérase représente une cible importante pour les traitements anticancéreux, son
inhibition entraînant la mort des cellules cancéreuses. Plusieurs alcaloïdes ont montré une
activité anticancéreuse en inhibant cette enzyme. Dans ce contexte, le programme Surflex a
été utilisé afin d’évaluer l’activité biologique (inhibition) de la télomérase, par cinq molécules
d’alcaloïdes "dérivés des acridines" : Le dérivé 12 présentant l'IC50 le plus bas (1 .35 μM), a
donné par simulation avec Surflex la meilleure affinité d'interaction (2.21 M-1). En fin nous
avons développé un nouveau dérivé plus puissant que le dérivé12, le changement du radicale
NR2 du dérivé augmente nettement l'affinité qui passe de 2,21 M-1
à 3,87 M-1. L’application
de la règle de 5 de Lipinski nous renseigne de manière positive sur les propriétés ADME de
cette nouvelle molécule théorique qui se présente comme un inhibiteur potentiellement plus
actif que les cinq alcaloïdes.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=5925 Réservation
Réserver ce document
Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MSBIO140082 MSBIO140082 Document électronique Bibliothèque principale Mémoires Disponible Documents numériques
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texte intégreAdobe Acrobat PDF PermalinkInhibition in silico de la Cyclo-Oxygénase 2 pour combattre le Cancer de prostate. / Abir Meguenani
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PermalinkPurification et caractérisation partielles et effet antiinflammatoire des lectines du champignon polypore soufré Polyporus sulphureus) / oumeima khattabi
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