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Affiner la rechercheApplication du docking moléculaire par surflex pour la mise en évidence des nouveaux inhibiteurs de la kinase dépendante de la cycline 2 (cdk2) . / El hadj tayeb Ghadhab
Titre : Application du docking moléculaire par surflex pour la mise en évidence des nouveaux inhibiteurs de la kinase dépendante de la cycline 2 (cdk2) . Type de document : texte imprimé Auteurs : El hadj tayeb Ghadhab, Auteur ; Maroua Soufi, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2020 Importance : 127 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : Mots clés : Docking moléculaire, Criblage virtuel, Surflex, RMSD, cdk2, Cancer, Inhibition, Lipinski, Biochimie Appliquée. Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Résumé:
La kinase dépendante de la cycline 2 représente une cible importante pour les traitements anticancéreux.
Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur que le composé «CK2» qui agit sur
la cible cdk2, enzyme impliquée dans les tumeurs. Le programme de docking moléculaire Surflex a été
développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs de
RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 65,5 % et un coefficient de corrélation de -0,63, les performances du
programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la superposition des ligands de
référence et ceux obtenus par docking moléculaire.
Un criblage virtuel a été effectué sur une collection de 236 structures avec un taux de similarité de 92% Ã
notre ligand de référence ont été téléchargés à partir de la chimiothèque « PubChem » afin d’évaluer leur affinité
envers la cdk2. Parmi les 236 structures, 22 composés ont présenté des affinités supérieures à celle de notre
ligand qui est de 4.63M-1.
Les résultats du criblage virtuel par le logiciel Surflex nous a permis de sélectionner les 5 meilleurs composés
qui peuvent être proposés comme meilleurs inhibiteurs de notre cible thérapeutique cdk2 et pour lesquels nous
avons fait une analyse détaillée des diverses interactions.
Nous avons complété nos essais de modélisation structurale par 20 mono substitutions et 35 bi substitutions,
dans le but d’améliorer son action inhibitrice. Parmi lesquelles dix-sept (17) composés substitués ont eu des
affinités améliorées :
La mono substitution concerne 20 composés et a permis une amélioration de l’affinité pour 8 composés ; la
meilleure (8.95 M-1) étant celle du composé n°1.
De la bi substitution résulte 35 composés parmi lesquels neuf (9) ont des affinités améliorées supérieures à 8.95
M-1 ; la meilleure étant celle du composé n°29 qui égale à 9.62 M-1.
Enfin, l'application de la règle de Lipinski nous informe de manière positive sur les propriétés
physicochimiques de ces nouvelles molécules ainsi que sur leur biodisponibilité par voie orale comme
médicament qui ne posera aucun problème.
Il est nécessaire de vérifier et valider nos résultats théoriques par une étude expérimentale in vitro et/ou in vivoDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=13286 Application du docking moléculaire par surflex pour la mise en évidence des nouveaux inhibiteurs de la kinase dépendante de la cycline 2 (cdk2) . [texte imprimé] / El hadj tayeb Ghadhab, Auteur ; Maroua Soufi, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2020 . - 127 f. ; 30 cm.
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Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : Mots clés : Docking moléculaire, Criblage virtuel, Surflex, RMSD, cdk2, Cancer, Inhibition, Lipinski, Biochimie Appliquée. Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Résumé:
La kinase dépendante de la cycline 2 représente une cible importante pour les traitements anticancéreux.
Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur que le composé «CK2» qui agit sur
la cible cdk2, enzyme impliquée dans les tumeurs. Le programme de docking moléculaire Surflex a été
développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs de
RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 65,5 % et un coefficient de corrélation de -0,63, les performances du
programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la superposition des ligands de
référence et ceux obtenus par docking moléculaire.
Un criblage virtuel a été effectué sur une collection de 236 structures avec un taux de similarité de 92% Ã
notre ligand de référence ont été téléchargés à partir de la chimiothèque « PubChem » afin d’évaluer leur affinité
envers la cdk2. Parmi les 236 structures, 22 composés ont présenté des affinités supérieures à celle de notre
ligand qui est de 4.63M-1.
Les résultats du criblage virtuel par le logiciel Surflex nous a permis de sélectionner les 5 meilleurs composés
qui peuvent être proposés comme meilleurs inhibiteurs de notre cible thérapeutique cdk2 et pour lesquels nous
avons fait une analyse détaillée des diverses interactions.
Nous avons complété nos essais de modélisation structurale par 20 mono substitutions et 35 bi substitutions,
dans le but d’améliorer son action inhibitrice. Parmi lesquelles dix-sept (17) composés substitués ont eu des
affinités améliorées :
La mono substitution concerne 20 composés et a permis une amélioration de l’affinité pour 8 composés ; la
meilleure (8.95 M-1) étant celle du composé n°1.
De la bi substitution résulte 35 composés parmi lesquels neuf (9) ont des affinités améliorées supérieures à 8.95
M-1 ; la meilleure étant celle du composé n°29 qui égale à 9.62 M-1.
Enfin, l'application de la règle de Lipinski nous informe de manière positive sur les propriétés
physicochimiques de ces nouvelles molécules ainsi que sur leur biodisponibilité par voie orale comme
médicament qui ne posera aucun problème.
Il est nécessaire de vérifier et valider nos résultats théoriques par une étude expérimentale in vitro et/ou in vivoDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=13286 Réservation
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Titre : caracterisation de nouveaux inhibiteurs de la ripk1, enzyme de la nécroptose Type de document : texte imprimé Auteurs : Amina Brahimi, Auteur ; Abir Bouguern, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2019 Importance : 136 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : docking moléculaire, surflex, autodock, nécroptose, RIPK1, Lipinski,Biochimie Appliquée. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Le but de ce travail était de trouver un composé à meilleur effet inhibiteur que le composé « 1HX » qui
agit sur la cible RIP1 Kinase, enzyme impliquée dans la nécroptose.
En premier lieu, on a réalisé une comparaison de deux logiciels « Autodock » et « Surflex » en utilisant
300 complexes. Nous avons obtenu les pourcentages de valeurs positives de RMSD suivants : 56.67%
pour Autodock et 62.67% pour Surflex. Et pour confirmation, ce test a été suivi d’une analyse visuelle
de la superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire pour les deux
logiciels.
Ensuite, nous avons déterminé le coefficient de corrélation linéaire « r » en utilisant 30 complexes. Les
valeurs obtenues sont de 0.6585 pour Autodock et de -0.7358 pour Surflex. Ainsi, nous avons poursuivi
notre étude par Surflex en raison de sa performance prouvée par le bon pourcentage de valeurs positives
du RMSD (62.67%) et un bon coefficient de corrélation (r = - 0.7358)
Un criblage virtuel a été effectué sur 311 similaires téléchargés de la Pubchem de notre ligand de
référence 1HX dont l’affinité est : 5.06 M-1. Les résultats de cette opération ont permis de sélectionner
les 4 meilleurs composés suivants : A, B, C et D. avec des affinités supérieures à 7 M-1.
Des substitutions ont été apportées à la structure de 1HX, notre ligand de référence, dans le but
d’améliorer son action inhibitrice. Nous avons effectué 2 types de substitution :
La mono substitution a concerné 10 composés et a permis une amélioration de l’affinité de sept d’entre
eux : 1, 2, 3, 6, 7, 8 et 9. Alors que la bi substitution, concernant 11 composés, a amélioré neuf d’entre
eux qui sont : 11, 12, 14, 15, 17, 18, 19, 20 et 21.
L’analyse visuelle des interactions n’a concerné que les composés A, B, C et D et 1, 11et 14 ayant une
affinité supérieure à 7 M-1.
Une évaluation positive des propriétés pharmacologiques par le logiciel « DruLiTo » a déduit que nos
composés peuvent agir comme médicament administré par voie orale.
Il est cependant nécessaire de vérifier et confirmer ces résultats théoriques par des études
expérimentales in vitro et/ou in vivoDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=11894 caracterisation de nouveaux inhibiteurs de la ripk1, enzyme de la nécroptose [texte imprimé] / Amina Brahimi, Auteur ; Abir Bouguern, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2019 . - 136 f. ; 30 cm.
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Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : docking moléculaire, surflex, autodock, nécroptose, RIPK1, Lipinski,Biochimie Appliquée. Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Le but de ce travail était de trouver un composé à meilleur effet inhibiteur que le composé « 1HX » qui
agit sur la cible RIP1 Kinase, enzyme impliquée dans la nécroptose.
En premier lieu, on a réalisé une comparaison de deux logiciels « Autodock » et « Surflex » en utilisant
300 complexes. Nous avons obtenu les pourcentages de valeurs positives de RMSD suivants : 56.67%
pour Autodock et 62.67% pour Surflex. Et pour confirmation, ce test a été suivi d’une analyse visuelle
de la superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire pour les deux
logiciels.
Ensuite, nous avons déterminé le coefficient de corrélation linéaire « r » en utilisant 30 complexes. Les
valeurs obtenues sont de 0.6585 pour Autodock et de -0.7358 pour Surflex. Ainsi, nous avons poursuivi
notre étude par Surflex en raison de sa performance prouvée par le bon pourcentage de valeurs positives
du RMSD (62.67%) et un bon coefficient de corrélation (r = - 0.7358)
Un criblage virtuel a été effectué sur 311 similaires téléchargés de la Pubchem de notre ligand de
référence 1HX dont l’affinité est : 5.06 M-1. Les résultats de cette opération ont permis de sélectionner
les 4 meilleurs composés suivants : A, B, C et D. avec des affinités supérieures à 7 M-1.
Des substitutions ont été apportées à la structure de 1HX, notre ligand de référence, dans le but
d’améliorer son action inhibitrice. Nous avons effectué 2 types de substitution :
La mono substitution a concerné 10 composés et a permis une amélioration de l’affinité de sept d’entre
eux : 1, 2, 3, 6, 7, 8 et 9. Alors que la bi substitution, concernant 11 composés, a amélioré neuf d’entre
eux qui sont : 11, 12, 14, 15, 17, 18, 19, 20 et 21.
L’analyse visuelle des interactions n’a concerné que les composés A, B, C et D et 1, 11et 14 ayant une
affinité supérieure à 7 M-1.
Une évaluation positive des propriétés pharmacologiques par le logiciel « DruLiTo » a déduit que nos
composés peuvent agir comme médicament administré par voie orale.
Il est cependant nécessaire de vérifier et confirmer ces résultats théoriques par des études
expérimentales in vitro et/ou in vivoDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=11894 Exemplaires
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Titre : Conception in silico de nouveaux inhibiteurs de l’alpha-glucosidase Type de document : texte imprimé Auteurs : Hadjer Zouggari, Auteur ; Med Reda Bensegueni, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2019 Importance : 55 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Surflex, docking moléculaire, diabète type 2, Alpha Glucosidase, inhibiteur,
scores, Lipinski,Biochimie Appliquée.Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Le docking moléculaire in silico est une approche théorique permettant
la prédiction du mode d’interaction d’un ligand avec son récepteur en donnant un éclairage
irremplaçable sur les interactions au niveau moléculaire. Dans notre travail, nous avons fait appel au
programme surflex afin de rechercher in silico de nouveaux inhibiteurs plus puissants de l’Alpha
Glucosidase; cible thérapeutique pour le traitement du diabète de type2. Les résultats du RMSD (80%≤2Å)
accompagnés par une analyse visuelle ont montré la fiabilité du programme Surflex. Afin de proposer de
nouveaux inhibiteurs potentiels de l’enzyme cible, un criblage virtuel d’une collection de 327 composés
similaires du miglitol, inhibiteur de référence, a été mené. A l’issue de ce criblage, les composés S142 et
S124 se présentent comme meilleurs inhibiteurs de l’alpha-glucosidase avec des scores d’affinités de 8.33 et
7.86 respectivement. Ces scores sont nettement supérieurs à celui obtenu avec le miglitol soit 2.44. Enfin, la
prédiction des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques ainsi que la toxicité potentielle a montré que
les composés S142 et S124 possèdent des propriétés compatibles avec une application biologiquDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=12456 Conception in silico de nouveaux inhibiteurs de l’alpha-glucosidase [texte imprimé] / Hadjer Zouggari, Auteur ; Med Reda Bensegueni, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2019 . - 55 f. ; 30 cm.
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Catégories : Biologie:Biochimie et Biologie Cellulaire et Moléculaire Tags : Surflex, docking moléculaire, diabète type 2, Alpha Glucosidase, inhibiteur,
scores, Lipinski,Biochimie Appliquée.Index. décimale : 730 Biochimie et biologie cellulaire Résumé : Le docking moléculaire in silico est une approche théorique permettant
la prédiction du mode d’interaction d’un ligand avec son récepteur en donnant un éclairage
irremplaçable sur les interactions au niveau moléculaire. Dans notre travail, nous avons fait appel au
programme surflex afin de rechercher in silico de nouveaux inhibiteurs plus puissants de l’Alpha
Glucosidase; cible thérapeutique pour le traitement du diabète de type2. Les résultats du RMSD (80%≤2Å)
accompagnés par une analyse visuelle ont montré la fiabilité du programme Surflex. Afin de proposer de
nouveaux inhibiteurs potentiels de l’enzyme cible, un criblage virtuel d’une collection de 327 composés
similaires du miglitol, inhibiteur de référence, a été mené. A l’issue de ce criblage, les composés S142 et
S124 se présentent comme meilleurs inhibiteurs de l’alpha-glucosidase avec des scores d’affinités de 8.33 et
7.86 respectivement. Ces scores sont nettement supérieurs à celui obtenu avec le miglitol soit 2.44. Enfin, la
prédiction des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques ainsi que la toxicité potentielle a montré que
les composés S142 et S124 possèdent des propriétés compatibles avec une application biologiquDiplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=12456 Réservation
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Titre : « Conception in silico de nouveaux inhibiteurs de la réplicase virale (ARN polymérase ARN-dépendante) (RdRp ou nsp12) du SARS-CoV-2 » Type de document : texte imprimé Auteurs : Rania Chaib, Auteur ; Choubeila Ikhelef, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2021 Importance : 110 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : criblage virtuel, Docking moléculaire, inhibiteur, lipinski, RMSD, RNA
polymérase RNA-dépendante ‘‘RdRp’’, Surflex,Biochimie Appliquée.Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Le but essentiel de ce travail est l’utilisation du docking moléculaire afin de développer in
silico de nouveaux inhibiteurs de la RNA polymérase RNA-dépendante ‘‘RdRp’’, cible
intéressante pour lutter contre la COVID-19.
Après confirmation de la fiabilité du logiciel Surflex par l’évaluation de trois paramètres : le
RMSD, le test de visualisation et le coefficient de corrélation, nous l’avons utilisé en vue de
découvrir de nouveaux inhibiteurs de notre cible la RdRp.
Pour cela, nous avons effectué un criblage de 200 structures avec un taux de similarité de
85% de notre ligand de référence, le composé GE6 dont l’affinité à notre cible est égale à 4.33
M-1 pour tenter d’identifier des inhibiteurs plus efficaces.
Trois structures parmi ces ligands ayant des affinités supérieures à 4.33 M-1 ont été retenues.
La majorité des paramètres physico-chimiques de ces composés n’étant pas conformes aux
critères imposés par la règle de Lipinski, nous avons essayé d’améliorer ses résultats en
modifiant légèrement la structure de base. Nous avons obtenu ainsi une nouvelle structure
ayant une affinité de 5.28 M- 1 supérieure à celle de notre ligand de référence et qui, de plus,
valide tous les critères de la règle de Lipinski.
A partir de cette structure de base, nous avons réalisé diverses substitutions : 62 monosubstitutions et 34 bi-substitutions. Parmi tous les composés obtenus, seulement 23 ont
présenté une affinité supérieure à celle de la molécule de départ et dont les meilleurs sont : le
composé mono-substitué M53 avec une affinité de 6.43 M-1 et le composé bi-substitué B20
avec une affinité de 7.11 M-1.
L’étude des paramètres physico-chimiques, pharmacocinétiques et de la toxicité par
l’utilisation d’un serveur « ADMETlab » montre que le composé B20, possédant la meilleure
affinité et un bon profil ADMET, peut être proposé comme un nouvel inhibiteur potentiel de
la RdRp.
Ces résultats obtenus in silico doivent être complétés par des études expérimentales in-vitro
et/ou in-vivo.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15763 « Conception in silico de nouveaux inhibiteurs de la réplicase virale (ARN polymérase ARN-dépendante) (RdRp ou nsp12) du SARS-CoV-2 » [texte imprimé] / Rania Chaib, Auteur ; Choubeila Ikhelef, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 110 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : criblage virtuel, Docking moléculaire, inhibiteur, lipinski, RMSD, RNA
polymérase RNA-dépendante ‘‘RdRp’’, Surflex,Biochimie Appliquée.Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : Le but essentiel de ce travail est l’utilisation du docking moléculaire afin de développer in
silico de nouveaux inhibiteurs de la RNA polymérase RNA-dépendante ‘‘RdRp’’, cible
intéressante pour lutter contre la COVID-19.
Après confirmation de la fiabilité du logiciel Surflex par l’évaluation de trois paramètres : le
RMSD, le test de visualisation et le coefficient de corrélation, nous l’avons utilisé en vue de
découvrir de nouveaux inhibiteurs de notre cible la RdRp.
Pour cela, nous avons effectué un criblage de 200 structures avec un taux de similarité de
85% de notre ligand de référence, le composé GE6 dont l’affinité à notre cible est égale à 4.33
M-1 pour tenter d’identifier des inhibiteurs plus efficaces.
Trois structures parmi ces ligands ayant des affinités supérieures à 4.33 M-1 ont été retenues.
La majorité des paramètres physico-chimiques de ces composés n’étant pas conformes aux
critères imposés par la règle de Lipinski, nous avons essayé d’améliorer ses résultats en
modifiant légèrement la structure de base. Nous avons obtenu ainsi une nouvelle structure
ayant une affinité de 5.28 M- 1 supérieure à celle de notre ligand de référence et qui, de plus,
valide tous les critères de la règle de Lipinski.
A partir de cette structure de base, nous avons réalisé diverses substitutions : 62 monosubstitutions et 34 bi-substitutions. Parmi tous les composés obtenus, seulement 23 ont
présenté une affinité supérieure à celle de la molécule de départ et dont les meilleurs sont : le
composé mono-substitué M53 avec une affinité de 6.43 M-1 et le composé bi-substitué B20
avec une affinité de 7.11 M-1.
L’étude des paramètres physico-chimiques, pharmacocinétiques et de la toxicité par
l’utilisation d’un serveur « ADMETlab » montre que le composé B20, possédant la meilleure
affinité et un bon profil ADMET, peut être proposé comme un nouvel inhibiteur potentiel de
la RdRp.
Ces résultats obtenus in silico doivent être complétés par des études expérimentales in-vitro
et/ou in-vivo.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15763 Réservation
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Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MSBIO210284 MSBIO210284 Document électronique Bibliothèque principale Mémoires Disponible Documents numériques
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Titre : Etude in silico de l’inhibition de la 3-chymotrypsin like protease en vue de combattre le syndrome respiratoire aigue severe (sras) Type de document : texte imprimé Auteurs : Manel Oulmi, Auteur ; Mira Zoubiri, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse Editeur : CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine Année de publication : 2021 Importance : 113 f. Format : 30 cm. Note générale : Une copie electronique PDF disponible au BUC Langues : Français (fre) Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : COVID-19, 3CLpro, Docking moléculaire, Inhibiteur, Surflex, RMSD, ADMET,Biochimie Appliquée Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : La pandémie actuelle de COVID-19 a déclenché des efforts mondiaux pour l'identification rapide
des vaccins et des traitements antiviraux spécifiques. 3CLpro joue un rôle clé dans le cycle de vie de
la réplication et de la maturation du coronavirus. Le Docking moléculaire est une méthode souvent
utilisée dans les phases initiales du processus de développement de nouveaux médicaments. Nous
l’avons utilisé Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur
que « Ebselen » qui agit sur la cible 3CL pro. Le programme de docking moléculaire Surflex a été
développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs
de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 61% et un coefficient de corrélation de 0,610, les
performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la
superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Dans un deuxième
temps, nous avons complété nos essais par une modélisation structurale en effectuant 63 mono
substitutions et 42 bi-substitutions, parmi lesquelles quelques composés substitués ont eu des
affinités améliorées. Le meilleur composé n°47 parmi les mono substitués a atteint une affinité de 5.32
M-1 et les meilleurs composés bi substitués n°26 et n°24 avec des affinités respectives de 6.21 M-1 et
6.02M-1. Enfin, l’étude des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques et de toxicité potentielle
montrent que le composé B24 a présenté un meilleur profil ADMET, par son métabolisme, et faible
toxicité aigüe, contrairement au composé de référence et au composé qui a une plus grande valeur
d’affinité B26. Nous le proposons donc comme nouvel inhibiteur éventuel de la 3CL pro.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15309 Etude in silico de l’inhibition de la 3-chymotrypsin like protease en vue de combattre le syndrome respiratoire aigue severe (sras) [texte imprimé] / Manel Oulmi, Auteur ; Mira Zoubiri, Auteur ; A Chikhi, Directeur de thèse . - CONSTANTINE [ALGERIE] : Université Frères Mentouri Constantine, 2021 . - 113 f. ; 30 cm.
Une copie electronique PDF disponible au BUC
Langues : Français (fre)
Catégories : Biologie:Biologie Appliquée Tags : COVID-19, 3CLpro, Docking moléculaire, Inhibiteur, Surflex, RMSD, ADMET,Biochimie Appliquée Index. décimale : 710 Biologie Appliquée Résumé : La pandémie actuelle de COVID-19 a déclenché des efforts mondiaux pour l'identification rapide
des vaccins et des traitements antiviraux spécifiques. 3CLpro joue un rôle clé dans le cycle de vie de
la réplication et de la maturation du coronavirus. Le Docking moléculaire est une méthode souvent
utilisée dans les phases initiales du processus de développement de nouveaux médicaments. Nous
l’avons utilisé Dans le but de concevoir de nouveaux composés à meilleur effet inhibiteur
que « Ebselen » qui agit sur la cible 3CL pro. Le programme de docking moléculaire Surflex a été
développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs
de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 61% et un coefficient de corrélation de 0,610, les
performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la
superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Dans un deuxième
temps, nous avons complété nos essais par une modélisation structurale en effectuant 63 mono
substitutions et 42 bi-substitutions, parmi lesquelles quelques composés substitués ont eu des
affinités améliorées. Le meilleur composé n°47 parmi les mono substitués a atteint une affinité de 5.32
M-1 et les meilleurs composés bi substitués n°26 et n°24 avec des affinités respectives de 6.21 M-1 et
6.02M-1. Enfin, l’étude des propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques et de toxicité potentielle
montrent que le composé B24 a présenté un meilleur profil ADMET, par son métabolisme, et faible
toxicité aigüe, contrairement au composé de référence et au composé qui a une plus grande valeur
d’affinité B26. Nous le proposons donc comme nouvel inhibiteur éventuel de la 3CL pro.Diplome : Master 2 Permalink : https://bu.umc.edu.dz/master/index.php?lvl=notice_display&id=15309 Réservation
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Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité MSBIO210126 MSBIO210126 Document électronique Bibliothèque principale Mémoires Disponible Documents numériques
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