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Partager le résultat de cette recherche Interroger des sources externesCaractérisation des souches bactériennes isolées à partir des nodules de quelques légumineuses endémiques de l’Algérie et détermination du polymorphisme génétique / Esma Torche
Titre : Caractérisation des souches bactériennes isolées à partir des nodules de quelques légumineuses endémiques de l’Algérie et détermination du polymorphisme génétique Type de document : texte imprimé Auteurs : Esma Torche, Auteur ; Yacine Benhizia, Directeur de thèse Editeur : constantine [Algérie] : Université Constantine 1 Année de publication : 2014 Importance : 123 f. Format : 30 cm. Note générale : 2 copies imprimées disponibles
Langues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Hedysarum naudinianum Hedysarum perrauderianum Mesorhizobium endémique Enterobacter nodules Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé : This work is carried out in order to study the bacterial symbiot of the root nodules of two wild legume species endemic to Algeria, Hedysarum naudinianum and Hedysarum perrauderianum. The cultivable isolated bacteria underwent a phenotypical characterization including a series of tests. The aptitude of the isolates to form nodules on the roots of the plants hosts is evaluated by the nodulation test. The profiles of the total proteins of the isolates are determined by electrophoresis SDS-PAGE. The molecular characterization is carried out by DNA-based identity analyses; ARDRA profile sorting and 16S rDNA sequencing. The results show that the nodules of the two legume species included enterobactériaceae having 100% 16S rDNA sequence identity with both Enterobacter cloacae and E. ludwigii. In H. perrauderianum, this taxon was the sole cultured isolate while the other legume H. naudinianum seems to lodge a large range of endophytes. While no culturable Rhizobium could be obtained, several attempts were carried out with the nodules of the two leguminous species. A method based on the cloning and the transformation revealed the existence of Mesorhizobium sp in the two species of Hedysarum. The sequence of Mesorhizobium in H. perrauderianum show identities to other mesorhizobia reported in different legumes from mediterranean to Far East locations. Therefore the sequence of the Mesorhizobium within H. naudinianum bears a mutation which is unique and originates a single nucleotide polymorphism (SNP). Data from the microsymbionts appear to suggest interesting clues to interpret the evolutionary ecology of their host plants.
Diplôme : Doctorat en sciences En ligne : ../theses/biologie/TOR6669.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=9805 Caractérisation des souches bactériennes isolées à partir des nodules de quelques légumineuses endémiques de l’Algérie et détermination du polymorphisme génétique [texte imprimé] / Esma Torche, Auteur ; Yacine Benhizia, Directeur de thèse . - constantine [Algérie] : Université Constantine 1, 2014 . - 123 f. ; 30 cm.
2 copies imprimées disponibles
Langues : Français (fre)
Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Hedysarum naudinianum Hedysarum perrauderianum Mesorhizobium endémique Enterobacter nodules Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé : This work is carried out in order to study the bacterial symbiot of the root nodules of two wild legume species endemic to Algeria, Hedysarum naudinianum and Hedysarum perrauderianum. The cultivable isolated bacteria underwent a phenotypical characterization including a series of tests. The aptitude of the isolates to form nodules on the roots of the plants hosts is evaluated by the nodulation test. The profiles of the total proteins of the isolates are determined by electrophoresis SDS-PAGE. The molecular characterization is carried out by DNA-based identity analyses; ARDRA profile sorting and 16S rDNA sequencing. The results show that the nodules of the two legume species included enterobactériaceae having 100% 16S rDNA sequence identity with both Enterobacter cloacae and E. ludwigii. In H. perrauderianum, this taxon was the sole cultured isolate while the other legume H. naudinianum seems to lodge a large range of endophytes. While no culturable Rhizobium could be obtained, several attempts were carried out with the nodules of the two leguminous species. A method based on the cloning and the transformation revealed the existence of Mesorhizobium sp in the two species of Hedysarum. The sequence of Mesorhizobium in H. perrauderianum show identities to other mesorhizobia reported in different legumes from mediterranean to Far East locations. Therefore the sequence of the Mesorhizobium within H. naudinianum bears a mutation which is unique and originates a single nucleotide polymorphism (SNP). Data from the microsymbionts appear to suggest interesting clues to interpret the evolutionary ecology of their host plants.
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Titre : Symbiose Rhizobium-Lupin. Biodiversité des microsymbiotes et leur caractérisation à partir des nodules racinaires de la Légumineuse Lupinus angustifolius. Type de document : texte imprimé Auteurs : Hanane Mellal, Auteur ; Yacine Benhizia, Directeur de thèse Editeur : جامعة الإخوة منتوري قسنطينة Année de publication : 2019 Importance : 130 f. Format : 30 cm. Note générale : Doctorat 3éme CYCLE LMD.
2 copies imprimées disponibles
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BiologieTags : Microbiologie: Ecologie Microbienne Lupinus angustifolius Bradyrhizobium Nodules Gènes de ménage Gènes symbiotique Biodiversité Housekeeping genes Symbiotic genes Biodiversity الجینات الوراثیة الجینات التكافلیة العقد الجذریة التنوع البیولوجي Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé :
In this study a total of 80 bacterial strains isolated from root nodules of Lupinus angustifolius grown wild in the North-Eastern Algerian region of El Tarf, The nodulation test confirmed the ability of 64 isolates to nodulate their original host plant. RAPD –PCR, distribut these isolates into 17 differents profiles. Analysis of 16S rRNA gene sequences of a representative strain of each profil showed that all the isolates belonged to the genus Bradyrhizobium, but their affiliation at the species level was not clear. For this reason the phylogenetic study based on the sequencing of housekeeping genes (glnII, recA) as well as symbiotic genes (nodC) was conducted. This analysis confirmed and clarified the previous results. Indeed, revealed the distribution of the strains into four large groups phylogenetically different. All the examined strains form a homogeneous group within the genistearum symbiovar of Bradyrhizobium. The strains were the subject of a phenotypic characterization namely: cultural characters, cellular, nutritional, physiological and biochemical, which confirm the biodiversity of Lupinus angustifolius strains isolated from Algeria. Based on the results obtained, this study revealed the diversity of the rhizobia nodulating Lupinus angustifolius, with some potentially new Bradyrhizobium species, requiring further taxonomic characterization for confirmation and formal description.
Note de contenu :
Annexes.Diplôme : Doctorat En ligne : ../theses/biologie/MEL7534.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=11374 Symbiose Rhizobium-Lupin. Biodiversité des microsymbiotes et leur caractérisation à partir des nodules racinaires de la Légumineuse Lupinus angustifolius. [texte imprimé] / Hanane Mellal, Auteur ; Yacine Benhizia, Directeur de thèse . - جامعة الإخوة منتوري قسنطينة, 2019 . - 130 f. ; 30 cm.
Doctorat 3éme CYCLE LMD.
2 copies imprimées disponibles
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Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Microbiologie: Ecologie Microbienne Lupinus angustifolius Bradyrhizobium Nodules Gènes de ménage Gènes symbiotique Biodiversité Housekeeping genes Symbiotic genes Biodiversity الجینات الوراثیة الجینات التكافلیة العقد الجذریة التنوع البیولوجي Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé :
In this study a total of 80 bacterial strains isolated from root nodules of Lupinus angustifolius grown wild in the North-Eastern Algerian region of El Tarf, The nodulation test confirmed the ability of 64 isolates to nodulate their original host plant. RAPD –PCR, distribut these isolates into 17 differents profiles. Analysis of 16S rRNA gene sequences of a representative strain of each profil showed that all the isolates belonged to the genus Bradyrhizobium, but their affiliation at the species level was not clear. For this reason the phylogenetic study based on the sequencing of housekeeping genes (glnII, recA) as well as symbiotic genes (nodC) was conducted. This analysis confirmed and clarified the previous results. Indeed, revealed the distribution of the strains into four large groups phylogenetically different. All the examined strains form a homogeneous group within the genistearum symbiovar of Bradyrhizobium. The strains were the subject of a phenotypic characterization namely: cultural characters, cellular, nutritional, physiological and biochemical, which confirm the biodiversity of Lupinus angustifolius strains isolated from Algeria. Based on the results obtained, this study revealed the diversity of the rhizobia nodulating Lupinus angustifolius, with some potentially new Bradyrhizobium species, requiring further taxonomic characterization for confirmation and formal description.
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Titre : Mise en évidence des Bactéries Nodulant les Légumineuses chez la plante Hedysarum pallidum Desf., poussant dans différents écosystèmes de l’Algérie Type de document : texte imprimé Auteurs : Leyla Boukous, Auteur ; Yacine Benhizia, Directeur de thèse Mention d'édition : 29/06/2020 Editeur : جامعة الإخوة منتوري قسنطينة Année de publication : 2020 Importance : 158 f. Format : 30 cm. Note générale : Doctorat 3éme CYCLE LMD.
1 copies imprimées disponibles
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BiologieTags : Microbiologie: Ecologie microbienne Hedysarum pallidum Desf. Nodules Diversité rhizobiums DGGE Mesorhizobium camelthorni Diversity العقد الجذرية التنوع Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé :
A collection of 81 isolates was obtained from fodder plant Hedysarum pallidum Desf. (Desfontaine) nodules growing in six geobioclimatic sites in Algeria. A preliminary characterization of the isolates underwenting phenotypic and symbiotic tests. The amplification of transcribed intergenic regions 16S-23S (ITS) and the partial 16Sr DNA gene sequencing allowing the assignment of representative isolates to the class of Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria and the phylum of Firmicutes, which indicates a high bacterial diversity associated with Hedysarum pallidum nodules. Interestingly, this study reported for the first time the isolation of culturable rhizobiums nodulating Hedysarum pallidum. Moreover, Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) highlighted the predominance of the non-culturable species Mesorhizobium camelthorni at all tested sites.
Note de contenu :
Annexes.Diplôme : Doctorat En ligne : ../theses/biologie/BOU7632.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=11467 Mise en évidence des Bactéries Nodulant les Légumineuses chez la plante Hedysarum pallidum Desf., poussant dans différents écosystèmes de l’Algérie [texte imprimé] / Leyla Boukous, Auteur ; Yacine Benhizia, Directeur de thèse . - 29/06/2020 . - جامعة الإخوة منتوري قسنطينة, 2020 . - 158 f. ; 30 cm.
Doctorat 3éme CYCLE LMD.
1 copies imprimées disponibles
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Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Microbiologie: Ecologie microbienne Hedysarum pallidum Desf. Nodules Diversité rhizobiums DGGE Mesorhizobium camelthorni Diversity العقد الجذرية التنوع Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé :
A collection of 81 isolates was obtained from fodder plant Hedysarum pallidum Desf. (Desfontaine) nodules growing in six geobioclimatic sites in Algeria. A preliminary characterization of the isolates underwenting phenotypic and symbiotic tests. The amplification of transcribed intergenic regions 16S-23S (ITS) and the partial 16Sr DNA gene sequencing allowing the assignment of representative isolates to the class of Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria and the phylum of Firmicutes, which indicates a high bacterial diversity associated with Hedysarum pallidum nodules. Interestingly, this study reported for the first time the isolation of culturable rhizobiums nodulating Hedysarum pallidum. Moreover, Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) highlighted the predominance of the non-culturable species Mesorhizobium camelthorni at all tested sites.
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Annexes.Diplôme : Doctorat En ligne : ../theses/biologie/BOU7632.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=11467 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité BOU/7632 BOU/7632 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible
Titre : Isolement et caractérisation des bactéries autochtones, nodulant les légumineuses, piégées à partir de l'habitat naturel de la légumineuse Pisum sativum L. Type de document : texte imprimé Auteurs : Univ. de Constantine, Éditeur scientifique Année de publication : 2010 Importance : 103 f. Note générale : 01 Disponible à la salle de recherche 01 Disponible au magazin de la B.U.C. 01 CD Langues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Symbiose Rhizobium léguminosarum bv Pisum sativum Piégeage Nodules Rhizophère Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie En ligne : ../theses/biologie/GAC5731.pdf Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=1833 Isolement et caractérisation des bactéries autochtones, nodulant les légumineuses, piégées à partir de l'habitat naturel de la légumineuse Pisum sativum L. [texte imprimé] / Univ. de Constantine, Éditeur scientifique . - 2010 . - 103 f.
01 Disponible à la salle de recherche 01 Disponible au magazin de la B.U.C. 01 CD
Langues : Français (fre)
Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Symbiose Rhizobium léguminosarum bv Pisum sativum Piégeage Nodules Rhizophère Index. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie En ligne : ../theses/biologie/GAC5731.pdf Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=1833 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité GAC/5731 GAC/5731 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible 
Titre : Diversité et structure génétique des populations de Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae isolées du pois (Pisum sativum) et de la lentille (Lens culinaris) cultivés dans deux zones éco-climatiques subhumide et semi-aride de l'est Algérien Type de document : texte imprimé Auteurs : Nassira Riah, Auteur ; Abdelhamid Djekoun, Directeur de thèse ; Gisèle Laguerre, Directeur de thèse ; Philippe De Lajudie, Directeur de thèse Editeur : constantine [Algérie] : Université Constantine 1 Année de publication : 2014 Importance : 131 f. Format : 30 cm. Note générale : 2 copies imprimées disponibles
Langues : Français (fre) Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Pois lentille nodosités Rhizobium diversité symbiose structure génétique des
populations Algérie zones éco-climatiques Pea lentil nodules diversity symbiosis genetic structure of populations Algeria eco-climatic zones البازلا العدس العقد الجذرية الريزوبيوم التنوع التكافل التركيبة الجينية للتجمعات الجزائر المناطق ذات مناخ بيئيIndex. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé :
The symbiosis Rhizobium-legume leads to the formation of root nodules fixing atmospheric nitrogen. This natural process has a considerable economic and agronomic interest. In Algeria, the production of food and forage legume is affected by environmental and climatic stresses (high temperature, water deficit...). In this study, total of 237 isolates were isolated from root nodules collected on lentil (Lens culinaris), proteaginous and forage peas (Pisum sativum) grown in the field in six sites representing two contrasting eco-climatic zones, sub humid and semi-arid in Eastern Algeria. The main objective was to determine the
degree of variability of the genetic structure of populations of Rhizobium nodulating among sites and isolated plants in different climatic conditions. Our isolates were characterized by PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the 16S-23S rRNA intergenic region (IGS), and the nodD-F symbiotic region. The combination of these haplotypes allowed to clustered the isolates into 26 distinct genotypes. Phylogenetic analysis of 16S rDNA sequences allowed us to classify all isolates as Rhizobium leguminosarum. Results obtained showed that the variation of symbiotic marker (nodD-F) is low with the predominance of one
haplotype nod g, previously recovered at high frequency in Europe. Sequence analysis of IGS further confirmed its high variability in the studied strains. An AMOVA analysis showed highly significant differentiation in the IGS haplotype distribution between populations from both eco-climatic zones. This difference was reflected by differences in dominant genotype frequencies. Conversely we could not detect any host plant effect. The nodD gene sequence based phylogeny suggests that symbiotic gene diversity in pea and lentil nodulating rhizobial populations in Algeria is low compared to that reported elsewhere in the world.Diplôme : Doctorat en sciences En ligne : ../theses/biologie/RIA6607.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=9720 Diversité et structure génétique des populations de Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae isolées du pois (Pisum sativum) et de la lentille (Lens culinaris) cultivés dans deux zones éco-climatiques subhumide et semi-aride de l'est Algérien [texte imprimé] / Nassira Riah, Auteur ; Abdelhamid Djekoun, Directeur de thèse ; Gisèle Laguerre, Directeur de thèse ; Philippe De Lajudie, Directeur de thèse . - constantine [Algérie] : Université Constantine 1, 2014 . - 131 f. ; 30 cm.
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Catégories : Français - Anglais
BiologieTags : Pois lentille nodosités Rhizobium diversité symbiose structure génétique des
populations Algérie zones éco-climatiques Pea lentil nodules diversity symbiosis genetic structure of populations Algeria eco-climatic zones البازلا العدس العقد الجذرية الريزوبيوم التنوع التكافل التركيبة الجينية للتجمعات الجزائر المناطق ذات مناخ بيئيIndex. décimale : 570 Sciences de la vie. Biologie Résumé :
The symbiosis Rhizobium-legume leads to the formation of root nodules fixing atmospheric nitrogen. This natural process has a considerable economic and agronomic interest. In Algeria, the production of food and forage legume is affected by environmental and climatic stresses (high temperature, water deficit...). In this study, total of 237 isolates were isolated from root nodules collected on lentil (Lens culinaris), proteaginous and forage peas (Pisum sativum) grown in the field in six sites representing two contrasting eco-climatic zones, sub humid and semi-arid in Eastern Algeria. The main objective was to determine the
degree of variability of the genetic structure of populations of Rhizobium nodulating among sites and isolated plants in different climatic conditions. Our isolates were characterized by PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the 16S-23S rRNA intergenic region (IGS), and the nodD-F symbiotic region. The combination of these haplotypes allowed to clustered the isolates into 26 distinct genotypes. Phylogenetic analysis of 16S rDNA sequences allowed us to classify all isolates as Rhizobium leguminosarum. Results obtained showed that the variation of symbiotic marker (nodD-F) is low with the predominance of one
haplotype nod g, previously recovered at high frequency in Europe. Sequence analysis of IGS further confirmed its high variability in the studied strains. An AMOVA analysis showed highly significant differentiation in the IGS haplotype distribution between populations from both eco-climatic zones. This difference was reflected by differences in dominant genotype frequencies. Conversely we could not detect any host plant effect. The nodD gene sequence based phylogeny suggests that symbiotic gene diversity in pea and lentil nodulating rhizobial populations in Algeria is low compared to that reported elsewhere in the world.Diplôme : Doctorat en sciences En ligne : ../theses/biologie/RIA6607.pdf Format de la ressource électronique : Permalink : index.php?lvl=notice_display&id=9720 Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité RIA/6607 RIA/6607 Thèse Bibliothèque principale Thèses Disponible Documents numériques
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